[发明专利]一种与斑点叉尾鮰生长相关的SNP标记及其应用在审
申请号: | 202111176337.4 | 申请日: | 2021-10-09 |
公开(公告)号: | CN113789392A | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | 钟立强;王明华;张世勇;姜虎成;陈校辉 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 江苏德善律师事务所 32488 | 代理人: | 赵鹏 |
地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 斑点 叉尾鮰 生长 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.一种斑点叉尾鮰生肌调节因子
2.一种影响斑点叉尾鮰生长的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记的DNA序列如SEQ IDNO:2所示,其中第391位W为碱基T或A。
3.如权利要求2所述的影响斑点叉尾鮰生长的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记,第391位基因型为TT、AA、AT。
4.权利要求2所述的SNP标记在判断斑点叉尾鮰生长快慢中的应用和/或在筛选快速生长斑点叉尾鮰中的应用。
5.一种斑点叉尾鮰
检测斑点叉尾鮰的SNP标记的第391位碱基处是否为AA基因型,所述SNP标记的DNA序列如SEQ ID NO:2所示;
若为AA基因型,则可作为生长速度快、遗传稳定的斑点叉尾鮰后备亲本。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:包括如下步骤,
1)提取斑点叉尾鮰基因组DNA;
2)以提取得到的基因组DNA为模板,PCR检测所述SNP标记的第391位基因型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:在步骤2)中,所述PCR检测具体操作为,
用引物F1和R1对斑点叉尾鮰基因组DNA进行PCR扩增,得到PCR产物,
SEQ ID NO:3,F1:5'-TCTTCCCTTCCAGGCTTACA-3';
SEQ ID NO:4,R1:5'-AGCAGCCGAGGACCTGTAAT-3'。
8.PCR产物经琼脂糖凝胶电泳检测后,进行测序分析。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述初次PCR扩增的反应体系为,
PCR扩增使用即用型UltraTaq酶PCR试剂盒,包括2×UltraTaq Master Mix 20 μl,基因组DNA 2 μl,上下游引物2 μl,ddH2O 14 μl;
扩增条件为:94℃预变性5min;94℃变性30s,59℃退火30s,72℃延伸60s,30个循环;72℃延伸10min。
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