[发明专利]一种与斑点叉尾鮰生长相关的SNP标记及其应用在审

专利信息
申请号: 202111176337.4 申请日: 2021-10-09
公开(公告)号: CN113789392A 公开(公告)日: 2021-12-14
发明(设计)人: 钟立强;王明华;张世勇;姜虎成;陈校辉 申请(专利权)人: 江苏省淡水水产研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 江苏德善律师事务所 32488 代理人: 赵鹏
地址: 210017 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 斑点 叉尾鮰 生长 相关 snp 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种斑点叉尾鮰生肌调节因子MyoG基因在亲本筛选中的应用。

2.一种影响斑点叉尾鮰生长的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记的DNA序列如SEQ IDNO:2所示,其中第391位W为碱基T或A。

3.如权利要求2所述的影响斑点叉尾鮰生长的SNP标记,其特征在于:所述SNP标记,第391位基因型为TT、AA、AT。

4.权利要求2所述的SNP标记在判断斑点叉尾鮰生长快慢中的应用和/或在筛选快速生长斑点叉尾鮰中的应用。

5.一种斑点叉尾鮰MyoG基因型的判断方法,其特征在于:

检测斑点叉尾鮰的SNP标记的第391位碱基处是否为AA基因型,所述SNP标记的DNA序列如SEQ ID NO:2所示;

若为AA基因型,则可作为生长速度快、遗传稳定的斑点叉尾鮰后备亲本。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:包括如下步骤,

1)提取斑点叉尾鮰基因组DNA;

2)以提取得到的基因组DNA为模板,PCR检测所述SNP标记的第391位基因型。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:在步骤2)中,所述PCR检测具体操作为,

用引物F1和R1对斑点叉尾鮰基因组DNA进行PCR扩增,得到PCR产物,

SEQ ID NO:3,F1:5'-TCTTCCCTTCCAGGCTTACA-3';

SEQ ID NO:4,R1:5'-AGCAGCCGAGGACCTGTAAT-3'。

8.PCR产物经琼脂糖凝胶电泳检测后,进行测序分析。

9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述初次PCR扩增的反应体系为,

PCR扩增使用即用型UltraTaq酶PCR试剂盒,包括2×UltraTaq Master Mix 20 μl,基因组DNA 2 μl,上下游引物2 μl,ddH2O 14 μl;

扩增条件为:94℃预变性5min;94℃变性30s,59℃退火30s,72℃延伸60s,30个循环;72℃延伸10min。

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