[发明专利]一种果桑新品种‘粤椹201’的SSR分子标记及其核心引物组、试剂盒和应用有效
申请号: | 202111190268.2 | 申请日: | 2021-10-13 |
公开(公告)号: | CN113637794B | 公开(公告)日: | 2021-12-21 |
发明(设计)人: | 王振江;罗国庆;唐翠明;钟建武;林森;陈莲 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星;蒋欢妹 |
地址: | 510610 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新品种 粤椹 201 ssr 分子 标记 及其 核心 引物 试剂盒 应用 | ||
1.一种用于鉴定果桑新品种‘粤椹201’的SSR分子标记,其特征在于,包括SSR分子标记M20310和/或M252;所述的SSR分子标记M20310的重复基序为(ATT)n,其中n≥5,其右侧序列如SEQ ID NO.6所示,其左侧序列如SEQ ID NO.5所示;所述的SSR分子标记M252的重复基序为(AT)n,其中n≥6,其右侧序列如SEQ ID NO.8所示,其左侧序列如SEQ ID NO.7所示。
2.一种用于鉴定权利要求1所述的果桑新品种‘粤椹201’的SSR分子标记的核心引物组,其特征在于,包括针对SSR分子标记M20310的引物和/或针对SSR分子标记M252的引物:
所述的针对SSR分子标记M20310的引物:
M20310-F:5’-AGGCTCTCAAGTTGGTAAAGAGG -3’;
M20310-R:5’-TCGATTCGATTTGTTCAGAAGAG -3’;
所述的引物M20310-F的5’端标记有荧光报告基团;
所述的针对SSR分子标记M252的引物:
M252-F:5’-ATGCTAGAACGAAGTCTCTGTGC-3’;
M252-R:5’-AGATACATATGTGCAAGCGGTTC-3’;
所述的引物M252-F的5’端标记有荧光报告基团。
3.根据权利要求2所述的用于鉴定果桑新品种‘粤椹201’的SSR分子标记的核心引物组,其特征在于,所述的荧光报告基团为FAM、HEX、TAMRA或ROX。
4.一种用于鉴定果桑新品种‘粤椹201’的快速检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求2或3所述的SSR分子标记的核心引物组。
5.一种利用SSR分子标记鉴定果桑新品种‘粤椹201’的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测果桑样品的基因组DNA;
(2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板,分别利用权利要求2或3所述的引物对M20310-F/M20310-R和M252-F/ M252-R进行PCR扩增;
(3)对步骤(2)中的PCR扩增产物进行分型,对分型结果进行条带判别;若以引物对M20310-F/M20310-R为引物扩增得到的PCR扩增产物只有138 bp和171 bp两条特异性条带,以引物对M252-F/M252-R为引物扩增得到的PCR扩增产物只有112 bp、114 bp和130 bp三条特异性条带,则表明待测果桑样品为‘粤椹201’,否则,则表明待测果桑样品为非‘粤椹201’。
6. 根据权利要求5所述的利用SSR分子标记鉴定果桑新品种‘粤椹201’的方法,其特征在于,步骤(2)所述的PCR扩增,其反应体系为20 μL,包括:50 ng/μL DNA模板0.5 μL、10×PCR buffer 2 μL、25 mM MgCl2 2 μL、10 mM dNTPs 0.5 μL、5 U/μL Taq DNA聚合酶0.2 μL、10 μM上游引物0.5 μL、10 μM下游引物0.5 μL和ddH2O 13.8 μL;步骤(2)所述的PCR扩增,其反应程序为:95℃预变性5 min;95℃变性30 s,60℃退火30 s,每个循环降1℃,72℃延伸30 s,循环10次;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸30 s,循环30次;最后72℃延伸5 min。
7.权利要求1所述的SSR分子标记在鉴定果桑新品种‘粤椹201’中的应用。
8.权利要求2或3所述的核心引物组或权利要求4所述的快速检测试剂盒在鉴定果桑新品种‘粤椹201’中的应用。
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