[发明专利]基于CRISPR-Cas触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统及其应用和方法在审
申请号: | 202111191999.9 | 申请日: | 2021-10-13 |
公开(公告)号: | CN113817807A | 公开(公告)日: | 2021-12-21 |
发明(设计)人: | 冯春凤;张立群;王云霞;熊瑜;刘飞;陈曼 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 重庆航图知识产权代理事务所(普通合伙) 50247 | 代理人: | 王贵君 |
地址: | 400038 *** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 crispr cas 触发 无非 特异 扩增 可视化 检测 系统 及其 应用 方法 | ||
1.基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:包括含茎环结构的单链RNA、环形的单链核酸、具有反式切割活性的Cas酶、RCA反应试剂和G-四链体/hemin DNAzyme催化ABTS显色体系;
所述单链RNA与待检双链DNA靶标中的一条链部分同源且能与另一条链互补结合,所述单链RNA能与Cas酶结合形成复合体,所述复合体在待检靶标存在下附属切割活性被激活;
所述环形的单链核酸能与RCA引物结合并扩增,且扩增产物能产生G-四链体的序列,还具有Cas酶附属切割位点序列;
所述G-四链体/hemin DNAzyme催化ABTS显色体系由hemin溶液、含K+的缓冲液、H2O2溶液和ABTS缓冲液构成,所述扩增产物在含K+和hemin溶液中形成G-四链体/hemin DNAzyme复合物,所述G-四链体/hemin DNAzyme复合物与H2O2溶液和ABTS缓冲液发生颜色反应。
2.根据权利要求1所述基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:所述单链RNA的浓度为15~35nmol/L;所述Cas酶浓度为15~30nmol/L;所述phi29 DNA聚合酶含量为0.1~2U;所述含K+的缓冲液的pH为4~8。
3.根据权利要求1所述基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:所述G-四链体/hemin DNAzyme催化ABTS显色体系中hemin溶液为10μmol/Lhemin;所述含K+的缓冲液各组分如下:50mmol/L HEPES,400mmol/L NaCl,40mmol/L KCl,0.1%Triton X-100,2%DMSO,pH 7.0;所述H2O2溶液为40mmol/L H2O2;所述ABTS缓冲液由pH 4.5的醋酸-醋酸钠缓冲液溶解ABTS至浓度为7.5mmol/L。
4.根据权利要求1所述基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:所述RCA反应体系含有RCA引物、phi29 DNA聚合酶、dNTPs以及1×phi29 DNA聚合酶反应缓冲液。
5.根据权利要求1所述基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:所述待检靶标为EGFR 19del,所述单链RNA序列如SEQ ID NO.1所示,所述环形的单链核酸序列如SEQ ID NO.2所示。
6.根据权利要求4所述基于CRISPR-Cas12a触发无非特异滚环扩增的可视化检测系统,其特征在于:所述RCA引物为如SEQ ID NO.5所示。
7.权利要求1~6任一项所述可视化检测系统在检测待检靶标试剂中的应用。
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