[发明专利]一种蓝氏贾第虫LAMP快速检测方法在审
申请号: | 202111201091.1 | 申请日: | 2021-10-15 |
公开(公告)号: | CN113755560A | 公开(公告)日: | 2021-12-07 |
发明(设计)人: | 高海慧;康晓冬;王栋;王建东;黎玉琼;马小明;王晓春;郭亚南;侯鹏霞;马吉峰;马丽娜;王锦;赵正伟;张俊丽;施安;王川 | 申请(专利权)人: | 宁夏农林科学院动物科学研究所(宁夏草畜工程技术研究中心) |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6893;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 浙江专橙律师事务所 33313 | 代理人: | 谢雨晴 |
地址: | 750000 宁夏回族*** | 国省代码: | 宁夏;64 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 蓝氏贾第虫 lamp 快速 检测 方法 | ||
1.一种蓝氏贾第虫LAMP快速检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤一、根据NCBI中已有的蓝氏贾第虫序列,通过序列比对,多次试验的方法,筛选到可以用于蓝氏贾第虫LAMP的序列,用软件设计蓝氏贾第虫LAMP引物3组,筛选到最佳引物1组,合成蓝氏贾第虫巢氏PCR引物2对;
步骤二、按照LAMP检测试剂盒扩增反应体系,对反应体系进行优化,通过调整引物、MgCl2、ThermoPol reaction buffer、dNTP mixture、DNA模板和Bst DNA聚合酶的浓度,确定LAMP反应的最佳反应体系;
步骤三、以蓝氏贾第虫、隐孢子虫、阿米巴原虫、芽囊原虫和弓形虫阳性样品基因组DNA作为模板,以超纯水为阴性对照,加入LAMP反应管中进行特异性试验;
步骤四、向反应管中加入1μL 1000×SYBR Green I,在自然光下用肉眼观察,呈现绿色判定为阳性,保持棕色不变判定为阴性;
步骤五、将蓝氏贾第虫阳性样本的总DNA进行倍比稀释后作为模板,分别用优化后的LAMP反应体系和巢氏PCR进行检测,进行引物敏感性试验;
步骤六、采集新鲜犊牛粪便样本,提取DNA,于-20℃环境下保存备用;
步骤七、分别用优化后的LAMP反应体系和巢氏PCR进行步骤六提取的DNA检测,比较两种方法检测蓝氏贾第虫的阳性率是否具有差异。
2.根据权利要求1所述的一种蓝氏贾第虫LAMP快速检测方法,其特征在于:提取待检样品的DNA是按照粪便基因组DNA提取试剂盒提取待检样品的DNA。
3.根据权利要求1所述的一种蓝氏贾第虫LAMP快速检测方法,其特征在于:3组引物的序列分别为:
第1组:
F3 ATGGACGACGGCCAGG B3 CCCTCGTACCAGGGCATC
FIP AGCCGATGTTCTTGAGCTGCTT-GTACTCGAAGGAGCGCTACG
BIP GGAAGAAGGCCGAGGAGTTCG-TTGTCGGACCTCTCCATGA
LF TCATCTCGCCCTTGATCTCG
LB CTGGACCGGGGACAACA;
第2组:
F3 ACTCGAAGGAGCGCTACG B3 GCGTCGATCAGGCACG
FIP CTCGGCCTTCTTCCAGCCG-ACGAGATCAAGGGCGAGATG
BIP TTCGACTACATCCCGACGTCCG-CCTCGTACCAGGGCATCT
LB GGGACAACATCATGGAGAGGT;
第3组:
F3 GCCGGGATCTCGAAGGAC B3 TCGGGATGTAGTCGAACTCC
FIP TGACCTGGCCGTCGTCCATCTT-GCGACGCTCGCGAACA
BIP GTACTCGAAGGAGCGCTACGAC-GCCTTCTTCCAGCCGATG
LF ATCGTCTTGATCCCGAGCG
LB CAAGGGCGAGATGATGAAGCA;
其中,第2组为最佳引物组。
4.根据权利要求1所述的一种蓝氏贾第虫LAMP快速检测方法,其特征在于:巢氏PCR引物序列为:
G7F AAGCCCGACGACCTCACCCGCAGTGC
G7R GAGGCCGCCCTGGATCTTCGAGACGAC
Giar F GAACGAACGAGATCGAGGTCCG
Giar R CTCGACGAGCTTCGTGTT。
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