[发明专利]一种基于硅基微流片的CYP2C19基因分型的检测试剂、试剂盒和方法在审
申请号: | 202111206846.7 | 申请日: | 2021-10-14 |
公开(公告)号: | CN113789375A | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | 谢毅;肖自力;朱建伟 | 申请(专利权)人: | 联合基因生物科技(上海)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 郎祺 |
地址: | 200092 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 硅基微流片 cyp2c19 基因 检测 试剂 试剂盒 方法 | ||
1.一种基于硅基微流片的CYP2C19基因分型的检测试剂,作为qPCR反应的缓冲液,其特征在于,包括Tris盐、MgCl2、KCl、海藻糖、Tween 20、Triton 100、DTT和BSA;所述检测试剂的pH值为8.9-9.2。
2.根据权利要求1所述的检测试剂,其特征在于,包括如下终浓度的组分:500-750mMTris盐、20-40mM MgCl2、500mM KCl、30-40%(m/v)海藻糖、0.1%(v/v)Tween 20、0.2%(v/v)Triton 100、25-50mmol/L DTT和10mg/ml BSA。
3.根据权利要求1所述的检测试剂,其特征在于,所述检测试剂的pH值是通过浓盐酸进行调整的。
4.根据权利要求1所述的检测试剂,其特征在于,所述检测试剂的配制方法包括如下步骤:
步骤一,称取相应重量的KCl、Tris盐、MgCl2加入到DEPC水中溶解,完全溶解后加入加浓盐酸调整到预期pH值;
步骤二,向得到的溶液中添加相应质量的海藻糖,适当加热搅拌待完全溶解,适当添加DEPC水;
步骤三,待冷却至室温后,添加DTT和BSA完全溶解;然后加入相应体积的Tween20和Triton100,充分搅拌混匀;
步骤四,定容,充分搅拌均匀,然后无菌过滤,-20℃保存备用。
5.一种含有如权利要求1-4任一项所述的检测试剂的基于硅基微流片的CYP2C19基因分型的试剂盒,其特征在于,主要针对突变型等位基因CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17进行鉴定。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,还包括引物探针组合物、模板DNA、dNTP、DNA聚合酶、ddH2O和硅基微流片。
7.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,引物探针组合物包括序列如SEQ ID NO:3~4、SEQ ID NO:7~8和SEQ ID NO:11~12的引物以及选自SEQ ID NO:1~2中的一条探针、选自SEQ ID NO:5~6中的一条探针、SEQ ID NO:9~10中的一条探针;优选地,所述探针标记有荧光基团和淬灭基团;所述荧光基团选自FAM和VIC中的一种,所述淬灭基团为MGB。
8.一种采用如权利要求5-7任一项所述试剂盒的基于硅基微流片的CYP2C19基因分型的方法,其特征在于,所述方法是基于硅基微流片采用荧光定量PCR技术;所述方法包括如下步骤:
步骤一,将qPCR反应体系混合均匀后,使用移液器将qPCR反应液添加到8通道硅基微流片的卡槽中,密封完成,将卡槽置于SPCR超快检测平台;
步骤二,设置荧光定量PCR仪PCR扩增程序,进行检测。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述qPCR反应体系的总体积为10μL,包括如下组分:所述检测试剂1.0μL,引物探针组合物0.2μL,dNTP 0.2μL,DNA聚合酶0.2μL~0.4μL,待测DNA样本2.0μL,余量为水;优选地,所述引物探针组合物中各引物和探针的浓度均为10mM,dNTP的浓度为10mM,DNA聚合酶的浓度为2.5U/μL,待测DNA样本的浓度为0.5-100ng/μL。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增程序为95℃2min;95℃5sec,60℃15sec,40个循环。
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