[发明专利]一种淫羊藿的DNA条形码、引物对及其应用在审

专利信息
申请号: 202111211906.4 申请日: 2021-10-18
公开(公告)号: CN114085920A 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 汪永平;刘红昌 申请(专利权)人: 贵州贵基生物医药有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 贵阳中工知识产权代理事务所 52106 代理人: 王蕊
地址: 557499 贵州省黔东南苗族*** 国省代码: 贵州;52
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摘要:
搜索关键词: 一种 淫羊藿 dna 条形码 引物 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种箭叶淫羊藿“黔藿1号”的DNA条形码,其特征在于:

包含ITS2序列:如SEQ ID NO.1 和SEQ ID NO.2 所示;

以及psbA-trnH序列:如SEQ ID NO.3 和SEQ ID NO.4所示。

2.一种箭叶淫羊藿“黔藿1号”的DNA条形码的PCR引物对,其特征在于:所述引物序列:

ITS2序列扩增正向引物:ITS2F: 5'-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3',

反向引物ITS2R: 5'-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3';

psbA-trnH序列扩增正向引物:psbAF: 5'-GTTATGCATGAACGTAATGCTC-3';

反向引物trnHR: 5'-CGCGCATGGTGGATTCACAATCC-3' 。

3.权利要求1所述的箭叶淫羊藿“黔藿1号”的DNA条形码或者权利要求2所述的PCR引物对在鉴别箭叶淫羊藿“黔藿1号”物种中的应用。

4.一种如权利要求1所述的箭叶淫羊藿“黔藿1号”的DNA条形码或者如权利要求2所述的PCR引物对的用途,其特征在于:用于鉴定箭叶淫羊藿“黔藿1号”这个品种。

5.一种鉴定箭叶淫羊藿“黔藿1号”的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求2所述的箭叶淫羊藿“黔藿1号”的DNA条形码的PCR引物对。

6.一种定量鉴定箭叶淫羊藿“黔藿1号”的方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)从待测样品中提取DNA;

(2)以步骤(1)中提取的DNA为模板,利用PCR引物进行ITS2的扩增;以无菌水为PCR空白对照,以箭叶淫羊藿“黔藿1号”基因组DNA为PCR阳性对照,所述PCR引物:ITS2序列扩增正向引物:ITS2F: 5'-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3',

反向引物ITS2R: 5'-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3';

(3)取步骤(2)扩增出的核苷酸片段用琼脂糖凝胶电泳分离,置于凝胶成像系统中观察,当空白对照扩增无任何带型,阳性对照有与理论相符的清晰、单一条带则说明PCR结果可靠;

(4)以ITS2的PCR扩增引物作为测序引物,使用DNA测序仪对目的条带进行双向测序,进而获得待测样品DNA的ITS2序列;设置以加去离子水代替加模板DNA的PCR反应为阴性对照;

(5)以步骤(1)中提取的DNA为模板,利用PCR引物进行psbA-trnH的扩增;以无菌水为PCR空白对照,以箭叶淫羊藿“黔藿1号”基因组DNA为PCR阳性对照,所述PCR引物:psbA-trnH序列扩增正向引物:psbAF: 5'-GTTATGCATGAACGTAATGCTC-3';

反向引物trnHR: 5'-CGCGCATGGTGGATTCACAATCC-3';

(6)以psbA-trnH的PCR扩增引物作为测序引物,使用DNA测序仪对目的条带进行双向测序,进而获得待测样品DNA的psbA-trnH序列;设置以加去离子水代替加模板DNA的PCR反应为阴性对照;

若获得的序列与SEQ ID NO.1 至SEQ ID NO.4中的相似度≥99%,则为“黔藿1号”这个物种,若低于这个值则为其他物种。

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