[发明专利]生物耗材PCR抑制剂残留的检测方法有效
申请号: | 202111219624.9 | 申请日: | 2021-10-20 |
公开(公告)号: | CN113755562B | 公开(公告)日: | 2022-07-12 |
发明(设计)人: | 张衡;丁贤明 | 申请(专利权)人: | 赛宁(苏州)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 南京利丰知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32256 | 代理人: | 王锋 |
地址: | 215000 江苏省苏州市工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物 耗材 pcr 抑制剂 残留 检测 方法 | ||
1.一种生物耗材PCR抑制剂残留的检测方法,其特征在于包括:
S1、将待检测的生物耗材置入无菌袋中,并加入初始浸润液浸没所述生物耗材,且使所述生物耗材与初始浸润液的质量体积比为1g:10mL,再在37℃放置1-2h,之后取出所述生物耗材,而将余留的浸润液作为待检测试样在室温下静置1-2h,然后均匀地分成m份,m≥3,分别记为溶液A1、溶液A2、…溶液Am,所述初始浸润液采用1×TE 缓冲液;
S2、将溶液A1均匀地分成n份,n≥3,分别标记为溶液A11、溶液A12、…溶液A1n;
S3、在溶液A11、溶液A12、…溶液A1n中分别加入包含SYBR Green试剂的荧光定量PCR试剂,所述荧光定量PCR试剂的试剂盒包含过量的SYBR Green试剂及PCR扩增组件;
S4、进行PCR实验,并在PCR扩增阶段根据实际实验信息确定基线与阈值,其中将基线设置为PCR初始扩增阶段PCR产物的量,并将阈值设置为所述基线的10倍,当扩增反应达到阈值时,分别记录溶液A11、溶液A12、…溶液A1n中每一个溶液中达到阈值时的Ct值,再排除其中被污染样本的Ct值,并计算剩余样本的Ct值的平均值,由此获得溶液A1组的Ct值,
其中,若溶液A11、溶液A12、…溶液A1n中一个溶液达到阈值时的Ct值与所有溶液达到阈值时的Ct值的平均值相差大于0.5,则将该溶液视为所述被污染样本;
S5、根据溶液A1组的Ct值,选择对溶液A2进行稀释或浓缩后继续进行检测,其中:
若溶液A1组的Ct值≤2,则将溶液A2稀释为溶液A1的10倍稀释液,溶液A3稀释为已经过10倍稀释的溶液A2的10倍稀释液,以此类推;
若溶液A1组的Ct值≥35,则将溶液A2浓缩为溶液A1的10倍浓缩液,溶液A3浓缩为已经过10倍浓缩的溶液A2的10倍浓缩液,以此类推;
若2<溶液A1组的Ct值<35,则将溶液A2浓缩为溶液A1的2倍浓缩液,溶液A3浓缩为2倍浓缩后的溶液A2的2倍浓缩液,以此类推;
并且,当溶液A1组的Ct值≤2,且已经过10倍稀释的溶液A2组的Ct值变化为>2且<35时,则将溶液A3浓缩为已经过10倍稀释的溶液A2的2倍浓缩液,以此类推;而当溶液A1组的Ct值≥35,且已经过10倍浓缩的溶液A2组的Ct值变化为>2且<35时,则将溶液A3浓缩为已经过10倍浓缩的溶液A2的2倍浓缩液,以此类推;
S6、按照步骤S2-步骤S5的操作,对溶液A2、…溶液Am的Ct值继续进行检测,直至连续三次测得的溶液Ai组的Ct值均>10而<35,i=1、2、3、…m,即获得待检测试样的Ct值,定义为试样组Ct值,同时确定以该溶液Ai组进行PCR实验时所采用的DNA模板浓度;
S7、将初始浸润液在37℃放置1-2h后,再在室温下静置1-2h,然后加入所述荧光定量PCR试剂,并使其中的DNA模板浓度达到与以所述溶液Ai组进行PCR实验时所采用的DNA模板浓度相同的DNA模板浓度,之后按照步骤S4的操作进行PCR实验,由此获得初始浸润液组的Ct值,定义为对照组Ct值;
S8、依据△Ct的数值判定生物耗材中是否有PCR抑制剂残留,其中△Ct =试样组Ct值-对照组Ct值,其中:
若△Ct>2,则判断待检测生物耗材中有PCR抑制剂残留,
若△Ct≤2,则判断待检测生物耗材中无PCR抑制剂残留;
其中,所述生物耗材为PCR用生物耗材,所述PCR抑制剂选自苯酚、聚丙烯、二甲苯胺中的任意一种。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,步骤S4中对溶液A11、溶液A12、…溶液A1n采用重复性实验检测方法。
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