[发明专利]一种弥漫大B细胞淋巴瘤的分型模型、分型方法和试剂盒

说明书

本发明涉及生物检测领域，具体涉及一种弥漫大B细胞淋巴瘤的分型方法、分型模型，还涉及一种用于对弥漫大B细胞淋巴瘤的靶向测序试剂盒和分型试剂盒。方法包括：获取最低样本量的弥漫大B细胞淋巴瘤样本；检测弥漫大B细胞淋巴瘤样本中18个相关基因的突变信息；将突变信息采用PAM算法聚类，建立分型模型，获得分出包含MCD型、N1型、EZB型、BN2型和Others型的分型模型。通过一致性的比较发现，应用NEJM50基因模型分出的结果和本发明的模型结果高度一致，本发明仅通过检测18个基因的突变信息即可完成分型，且测序成本较低、便于临床推广、降低了检测成本、经济实惠。

技术领域

本发明涉生物检测领域，具体涉及一种弥漫大B细胞淋巴瘤的分型模型、分型方法， 还涉及一种用于对弥漫大B细胞淋巴瘤的靶向测序试剂盒和分型试剂盒。

背景技术

淋巴瘤是我国发病率最高的血液系统恶性肿瘤，位列我国癌症发病率前十，大体可 以分为大体上可以分为霍奇金淋巴瘤(Hodgkin’s Lymphoma，HL)和非霍奇金淋巴瘤(Non-Hodgkin’s Lymphoma，NHL)两大类。其中弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse Large B CellLymphoma，DLBCL)是非霍奇金淋巴瘤中较为常见的且具有高度异质性的侵袭性 淋巴瘤。在我国的发病率占到非霍奇金淋巴瘤(NHL)总数的30％和占B-细胞非霍奇金 淋巴瘤(B-NHL)总数的50％以上。在预后和药物选择上，国际预后指数(International PrognosticIndex，IPI)是目前国际上常用的DLBCL预后和用药评估系统。此系统依据 多项独立的不良预后因素(包括年龄、Ann Arbor分期、结外累及部位、血清LDH水平、 体能状况、是否中枢侵犯等)进行评估分出不同的危险度(高危、中高危、中危和低危)。 虽然近年又修正添加了新的评估指数如Revised IPI(R-IPI)及年龄调整IPI(aa-IPI)等， 但是由于此类评分主要针对患者的自身状态，并没有考虑肿瘤本身的分子和生物学特 征，加之DLBCL肿瘤背景的复杂性，因此判断高危患者能力有限，对用药指导由一定 限制。随着分子生物学技术的发展，大量研究表明，通过基因检测，依据突变变化的特 点，可以从分子生物学角度解释DLBCL的致病发展过程，发现一系列与DLBCL预后 分型相关的信号通路及所包括基因。

2018年，R.Schmitz和B.Chapuy分别进行了针对DLBCL分子病理的全球多中心临床研究，对上百例患者的几百个相关基因进行了检测。并依据基因变化的特点，分别鉴 定出了5类的DLBCL分子亚型，分别是MCD亚型(以MYD88L265P和CD79B突变 为主要特征)、BN2型(BCL6融合及NOTCH2突变)、N1型(NOTCH1突变)以及 EZB型(以EZH2突变和BCL2易位为特征)，这不仅从分子生物学的角度解释了DLBCL 的致病过程，还发现了一些驱动基因的改变可能与DLBCL的预后和复发相关，如： CD79A/B、CARD11、TNFAIP3激活BCR-NF-κB信号通路；TP53、PTEN的突变使抑 癌基因失去抑癌作用等。这些都会加速疾病的进程，携带此类突变的患者预后往往不良。 其中新英格兰杂志5分型的方法(NEJM50基因模型)，目前在国际上被广泛认可，被 一些研究性医院作为DLBCL具有复发潜能的高危患者筛选的重要手段。

由于人类种群的差异性，以西方人群数据建立起来的模型算法在中国人群中并不适 用，部分基因的检出比例很低。如何建立一个适合中国人群的DLBCL复发潜能预测模 型成为了国内淋巴瘤研究者研究的热点。

同时基于高通量测序(NGS)技在淋巴瘤的诊断和治疗中已经起到越来越重要的作用。应用NGS同时检测成百上千突变基因的特点，结合病理、免疫表型等综合诊疗方 式，可以实现对淋巴瘤患者的精确诊断。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的首要发明目的在于提供一种建立弥漫大B细胞淋巴瘤的分型模型的方法。

本发明的第二发明目的在于提供该方法建立得到的模型。