[发明专利]与小麦旗叶宽主效QTL连锁的KASP-Flw-sau6198分子标记及其应用

说明书

本发明公开了与小麦旗叶宽主效QTL连锁的KASP‑Flw‑sau6198分子标记及其应用，属于分子生物学及作物遗传育种领域。所述分子标记为SNP分子标记，多态性为A/G，其与小麦旗叶宽QTL QFLW.sau‑AM‑4B.4共定位于四倍体小麦4B染色体长臂上，且位于QTL QFLW.sau‑AM‑4B.4区间内。经检测分析，表明该分子标记能准确跟踪所述小麦旗叶宽QTLQFLW.sau‑AM‑4B.4，预测小麦的旗叶宽特性，利于更快速筛选出具有较宽旗叶的小麦品种或品系用于育种，大大加快小麦育种的进程。

技术领域

本发明涉及分子生物学及作物遗传育种领域，特别是涉及与小麦旗叶宽主效QTL连锁的KASP-Flw-sau6198分子标记及其应用。

背景技术

小麦(Triticum sp.)是全球广泛种植的农作物之一，面对不断增长的世界人口，如何提高小麦产量成为摆在育种者面前的关键问题。

旗叶是小麦主要的光合作用器官，会影响作物干物质的积累和产量的形成。因此旗叶大小对小麦的最终产量具有很大的影响。旗叶宽是一种重要的农艺性状，既是小麦株型的重要构成因素之一，也是植物光合作用的主要器官，在小麦中对产量潜力起着重要作用。在灌浆期，种子的有机物一半是由旗叶提供，直接影响小麦的产量。此外，旗叶决定了小麦的冠层结构，它影响开花时间，光照量，光合作用，种子灌浆，并最终影响每株植物的籽粒产量。鉴于旗叶对增加产量的潜力，在QTL水平上加强对旗叶性状的研究，挖掘鉴定、解析和利用旗叶性状主效位点，会使我们对旗叶性状在产量形成中的作用以及提供小麦高产的新途径有更多的了解。然而，在普通小麦的改良过程中，由于对少数骨干亲本资源的利用，品种间的遗传多样性降低，产量受到狭窄的遗传基础的限制，这对未来的小麦改良育种的不利影响是显而易见的。但是，小麦近缘种中大量未开发的遗传资源可以有效帮助我们面对未来小麦生产的挑战，加速利用近缘种中独特的基因资源对于增加普通小麦的产量十分重要。

小麦旗叶性状是复杂的数量性状，通常是受一个基因网络控制，且其中多为微效基因，同时也受环境影响。由于表型和基因型之间并不能展现十分清晰的对应关系，故而増加了数量性状研究的困难性。第三代分子标记—单核苷酸多态性(Single NucleotidePolymorphism，SNP)的出现，为构建小麦高密度遗传连锁图谱和数量性状遗传研究提供了良好的平台，为这类复杂的数量性状位点(QTL)的分析提供了一条有效的途径。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)指的是基因组内DNA某一特定核苷酸位置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化而引起的DNA序列多态性。其技术是利用己知序列信息来比对寻找SNP位点，再利用发掘的变异位点设计特异性的引物来对基因组DNA或cDNA进行PCR扩增，得到基于SNP位点的特定的多态性产物，最后利用电泳技术分析产物的多态性。SNP标记的优点是数量多，分布广泛；在单个基因和整个基因组中分布不均匀；SNP等位基因频率容易估计。

KASP(Kompetitive Allele-Specific PCR)，即竞争性等位基因特异性PCR，通过引物末端碱基的特异匹配来对SNP以及In Del位点进行精准的双等位基因分型，作为一项灵活、经济、准确的SNP检测方法，在水稻、小麦、大豆等作物的分子标记辅助选择中得到广泛应用。

目前已有对旗叶宽进行QTL定位相关报道，发现了与之相关的QTL在小麦中广泛存在，并且分布在小麦的不同染色体上。然而目前与小麦旗叶宽性状相关且可用于实际分子育种的紧密连锁的分子标记却并不多。因此研究获得有关旗叶宽的QTL或基因，对选择合适旗叶宽小麦植株以及利用分子生物学技术进行小麦育种具有重要的指导意义。

发明内容