[发明专利]免疫相关基因在乳腺癌预后的试剂盒和系统中的应用

权利要求书

1.一组乳腺癌免疫相关基因，其特征在于，包括免疫相关基因THBS1、S100A11、LANCL1、PDGFRB、ACO1、SEMA3G、ACVR1B、IGF1R、NR2F1、PGRMC2、PPARA和TNFRSF18。

2.如权利要求1所述的乳腺癌免疫相关基因的联合使用在制备用于预测Luminal B型乳腺癌病人预后的试剂盒中的应用。

3.检测免疫相关基因的表达水平的试剂在制备用于预测Luminal B型乳腺癌病人预后的试剂盒中的应用。

4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂用于检测THBS1、S100A11、LANCL1、PDGFRB、ACO1、SEMA3G、ACVR1B、IGF1R、NR2F1、PGRMC2、PPARA和TNFRSF18的mRNA表达水平。

5.一种用于预测Luminal B型乳腺癌病人预后的试剂盒，其特征在于，包括用于检测免疫相关基因mRNA表达水平的试剂；所述免疫相关基因包括THBS1、S100A11、LANCL1、PDGFRB、ACO1、SEMA3G、ACVR1B、IGF1R、NR2F1、PGRMC2、PPARA和TNFRSF18。

6.一种用于预测Luminal B型乳腺癌病人预后的系统，其特征在于，所述系统包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块；所述数据输入模块用于将乳腺癌病人的免疫相关基因的mRNA表达值的结果输入模型计算模块；所述模型计算模块包括LASSOCox风险模型，用于根据乳腺癌病人免疫相关基因的mRNA表达值以及LASSOCox风险模型计算病人风险分数；所述结果输出模块用于根据乳腺癌病人风险分数来预测乳腺癌病人治疗后的预后风险。

7.如权利要求6所述的系统，其特征在于，所述数据输入模块中的mRNA表达值为通过Bioconductor的GEOquery程序包标准化处理后的mRNA表达水平数据。

8.如权利要求6所述的系统，其特征在于，所述模型计算模块中的风险分数的计算公式为：Risk score＝0.090×exp(THBS1的mRNA表达值)+0.213×exp(S100A11的mRNA表达值)-0.047×exp(LANCL1的mRNA表达值)+0.254×exp(PDGFRB的mRNA表达值)-0.289×exp(ACO1的mRNA表达值)-0.287×exp(SEMA3G的mRNA表达值)+0.343×exp(ACVR1B的mRNA表达值)-0.157×exp(IGF1R的mRNA表达值)+0.093×exp(NR2F1的mRNA表达值)-0.156×exp(PGRMC2的mRNA表达值)-0.555×exp(PPARA的mRNA表达值)-0.070×exp(TNFRSF18的mRNA表达值)。

9.如权利要求8所述的系统，其特征在于，所述模型计算模块中的高风险组和低风险组的cutoff值-1.169。

10.如权利要求6所述的系统，其特征在于，所述结果输出模块中，当乳腺癌病人风险分数≥-1.169时，乳腺癌病人为高风险，生存会显著差，需要更多的临床关注和更好的临床管理；当乳腺癌病人风险分数-1.169时，乳腺癌病人为低风险，生存较好，可以用更温和的治疗方案，避免过度治疗。