[发明专利]检测人类RET基因M918T突变的试剂盒、反应体系及方法在审
申请号: | 202111297316.8 | 申请日: | 2021-11-04 |
公开(公告)号: | CN113930513A | 公开(公告)日: | 2022-01-14 |
发明(设计)人: | 王鑫;郭可夫;周安安 | 申请(专利权)人: | 武汉承启医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 人类 ret 基因 m918t 突变 试剂盒 反应 体系 方法 | ||
1.检测人类RET基因M918T突变的试剂盒,其特征在于,所述检测人类RET基因M918T突变的试剂盒包括:
引物组合,所述引物组合包括上游引物和下游引物;
探针组合,所述探针组合包括检测M918T突变的荧光探针和检测野生型的荧光探针;
第一试剂包和第二试剂包,所述第一试剂包和第二试剂包各自包含PCR缓冲液,dNTP,MgCl2,特异性探针,锁核酸引物,内标系统,HotStartTaq酶、UNG酶,其中第一试剂包还包含引物对SEQIDNO:11和SEQIDNO:22,探针SEQIDNO:33,第二试剂包包含引物对SEQIDNO:111和SEQIDNO:44,探针SEQIDNO:55,其中SEQIDNO:44为锁核酸引物。
2.如权利要求1所述的人类RET基因M918T突变的检测试剂盒,其特征在于,探针SEQIDNO:33、SEQIDNO:55的5’端连接有荧光基团,3’端连接有淬灭基团,所述荧光基团可以为FAM、VIC或HEX。
3.如权利要求1所述的人类RET基因M918T突变的检测试剂盒,其特征在于,第一试剂包和第二试剂包中均含有ROX参比校正,所述检测试剂盒含有阳性对照液和空白对照液,所述阳性对照液含有M918T突变质粒DNA,所述空白对照为Tris-HCl缓冲液。
4.快速检测权利要求1所述的人类RET基因M918T突变的方法,该方法包括以下步骤:
(1)设计并筛选含有人类RET基因质控的引物、探针,含有检测M918T突变的荧光探针和检测野生型的荧光探针,上游引物和下游引物;
(2)获得待测样品基因组DNA;
(3)取权利要求1-3中任一项所述的检测试剂盒,将所述基因组DNA先后取相同的量加入所述第一试剂和所述第二试剂中并同时进行PCR反应,根据两个PCR反应体系分别得到的Ct值的差值△Ct判断是否具有相应的基因突变。
5.检测人类RET基因M918T突变的方法,该方法利用权利要求1至4任一项所述的检测试剂盒进行,该方法包括以下步骤:
(1)获得待测样品基因组DNA;
(2)将上述获得的基因组DNA先后取同样量分别加入含有本发明的检测试剂盒中第一试剂包的PCR反应体系和含有本发明的检测试剂盒中第二试剂包的PCR反应体系中,并使该两个反应体系同时进行PCR反应,两个PCR反应彼此独立进行,根据两个PCR反应体系分别得到的Ct值的差值△Ct判断是否具有相应的基因突变。
6.如权利要求4或5所述的方法,其特征在于,根据以下条件进行所述判断:
△Ct9则待测样品存在RET基因M918T突变;△Ct值≥9则待测样品无RET基因M918T突变或突变丰度低于本试剂盒突变检测下限。
7.如权利要求4或5所述的方法,其特征在于,还包括对上样量是否合适进行判断的步骤,判断依据如下:
Ct0≤32则上样量合适,检测结果有效;Ct032则上样量偏低,需增加上样量后重新检测,
其中,所述Ct0为所述第一试剂包对应的Ct值。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述△Ct值≥9的情况包括所述第二试剂包进行PCR反应后无Ct值的情况。
9.如权利要求4-8中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应条件为:
95℃4~11min;
95℃15~30s,60℃45~60s,40~48个循环。
10.如权利要求4-8中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应条件优选为:
38℃9min;
95℃5min;
95℃15s,60℃60s,48个循环。
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