[发明专利]克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用有效
申请号: | 202111298317.4 | 申请日: | 2021-11-04 |
公开(公告)号: | CN113897442B | 公开(公告)日: | 2023-02-14 |
发明(设计)人: | 白旭峰;任鑫;李庆;彭国辉;彭波 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 克氏原螯虾中 一个 抗病 基因 及其 优异 单倍型 标记 应用 | ||
1.一种克氏原螯虾R基因SNP分子标记的引物在非治疗和非诊断目的的克氏原螯虾R基因抗病能力SNP基因型筛选中的应用,其特征在于所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQID NO:1所示,在该序列的第335位,450位和469位存在等位基因的突变,其中,第335位为C/T突变,450位为C/T突变和469位为G/A突变;所述引物的核苷酸序列如下所示:
正向引物 R-F:5’-CTCACCACGCCCTCGGAGAT-3’,
反向引物 R-R:5’- GGCGACTTACAACCAACGG GA-3’;
以克氏原螯虾DNA为模板,使用引物在如下PCR反应体系及条件下进行扩增:
PCR反应体系:10μl 2×PCR Mix,R基因正、反向引物各1μl,200ng/μl的克氏原螯虾cDNA 1μl,加超纯水7μl;
PCR反应条件:95℃预变性5 min;95℃变性30s;60℃退火30s;72℃延伸30s;35次循环后,在72℃再延伸10 min;4℃保存;
将产物进行测序分析,通过序列比对,确定克氏原螯虾R基因存在三个SNP位点:即第335位存在C/T多态位点,450位存在C/T多态位点和469位存在G/A多态位点;当克氏原螯虾R基因SNP突变位点组合为CCA时,克氏原螯虾对副溶血弧菌具有较强的抗病能力。
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