[发明专利]克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用

说明书

本发明属于动物分子标记筛选领域，具体涉及克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用。从克氏原螯虾Cluster‑48199(R))基因组中获得一个基因片段，该基因片段全长为559bp；该基因片段即是本发明克隆的分子标记，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1所示，在该基因片段的第335位(C/T)，450位(C/T)和469位(G/A)存在一个等位基因的突变位点。本发明还涉及扩增Cluster‑48199(R)基因的引物组合，和用于检测该分子标记应用的引物组合。本发明利用转录组技术挖掘出克氏原螯虾新的抗病基因，并筛选出其抗病SNP单倍型标记。

技术领域

本发明属于动物分子标记筛选领域，具体涉及克氏原螯虾中一个抗病基因及其抗病优异单倍型标记的应用。

技术背景

克氏原螯虾俗称小龙虾又名红色沼泽螯虾。原产于墨西哥北部和美国南部，隶属于节肢动物门，甲壳纲，软甲亚纲，十足目，螯虾科，原螯虾属。在1918年被引入日本本州地区，20世纪30年代末期引入我国南京。近年来，由于小龙虾极强的环境适应和繁殖能力，数量增长极快，已经在部分湿地中形成了优势种群，并在长江流域广泛存在。

克氏原螯虾肉质鲜美，营养丰富，其肌肉中蛋白质含量极高，而卵黄腺中含有丰富的不饱和脂肪酸、多种游离氨基酸、维生素等，近年来深受年轻人的喜爱。在这种背景下，小龙虾人工养殖的规模不断扩大，带来的经济效益也逐年增加。然而，不断增加的养殖密度，集约化养殖模式的推广使得小龙虾病害频发，带来了巨大的经济损失。由于小龙虾属于低等动物，其体内的免疫调控机制尚不明确，除此之外，对于小龙虾病害种类划分、发病原因、治疗方法的研究也尚处于起步阶段，使得病害防治一直是小龙虾养殖中的关键问题。因此，挖掘新的抗病基因，培育优良的小龙虾抗病品种是现在研究的重点内容。

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性，是可遗传变异中最常见的一种，它广泛存在于各种生物之中，并且具有很高的遗传稳定性。近年来，利用SNP标记进行品种选育也成为主流的选育手段之一。这一选育方法，在农作物及大型家畜中均已取得了良好的研究成果。然而在水产领域，SNP标记的应用尚处于空白阶段。因此，SNP育种在水产中的应用是现在的研究重点之一。不仅如此，近年来不断发展的测序技术也为SNP育种提供了良好的基础。利用测序技术建立基因库，并以基因库为基础筛选优异抗病等位基因，这种测序技术和SNP标记相互结合的方法为小龙虾抗病品种选育提供了新的思路。

本发明利用克氏原螯虾抗病转录组信息，根据转录组中的差异表达基因信息，筛选出抗病基因，并进一步开发其SNP位点，筛选出一种优异的抗病性状SNP单倍型标记。

发明内容

本发明的目的在于克服克氏原螯虾育种的困难，利用转录组挖掘克氏原螯虾新的抗病基因，并筛选出其抗病SNP单倍型。利用本发明可以提高克氏原螯虾抗病能力，为克氏原螯虾抗病育种提供新的技术方案，对选育克氏原螯虾抗病品种具有着重要意义。

本发明的技术方案如下所述：

一种分子标记在非诊断目的的筛选在克氏原螯虾R基因抗病能力中的应用，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1所示，具体如下所示：