[发明专利]一种HER2阳性胃癌免疫微环境特征的分析方法及应用有效
申请号: | 202111314462.7 | 申请日: | 2021-11-08 |
公开(公告)号: | CN114113012B | 公开(公告)日: | 2023-06-13 |
发明(设计)人: | 沈琳;赵兴旺 | 申请(专利权)人: | 北京市肿瘤防治研究所 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
代理公司: | 北京万思博知识产权代理有限公司 11694 | 代理人: | 刘冀 |
地址: | 100082*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 her2 阳性 胃癌 免疫 环境 特征 分析 方法 应用 | ||
1.一种 HER2 阳性胃癌免疫微环境特征的分析方法,其特征在于,所 述方法以 HER2阳性胃癌患者的活检病理切片为分析载体,通过对病理切 片免疫微环境中的细胞进行免疫荧光染色示踪定位,通过分析肿瘤细胞与 免疫细胞之间,或者不同免疫细胞类型之间的细胞核间距,捕捉 HER2 阳 性胃癌免疫微环境特征;所述免疫微环境中的细胞包括胃粘膜上皮细胞、 HER2 表达阳性上皮细胞,NK 细胞、NKT 细胞、M2 巨噬细胞、B 淋巴细胞、 Treg细胞和 CTL 细胞;
以 0-10 微米、10-20 微米、20-30 微米为统计分析维度,作为细胞之 间的共定位互作的细胞核间距离衡量范围,并通过进行空间距离聚类分析, 计算具有 0-10 微米、10-20微米、20-30 微米为距离临近细胞相匹配的细 胞数量,并归一化为在细胞总类型中所占比率,以此来计算细胞类型的有 效百分比,捕捉所述 HER2 阳性胃癌免疫微环境特征;
所述方法具体包括:
步骤 (1) 对 HER2 阳性胃癌患者的活检病理切片进行 HE 染色,确定 发生癌变的肿瘤核心区域和非癌变的癌旁区域;
步骤 (2) 病理免疫微环境中细胞的荧光染色示踪与定位,所述细胞 包括胃粘膜上皮细胞、HER2 表达阳性上皮细胞,NK 细胞、NKT 细胞、M2 巨噬细胞、B 淋巴细胞、Treg 细胞和 CTL 细胞;
步骤 (3) 对免疫荧光标记后的切片样本进行全景扫描,并对照 HE 染 色的病理区域划分,对癌变区域进行精细扫描;
步骤 (4) 对癌变区域的图像进行亚微结构的精细拆分、细胞类型区 别、蛋白Marker表达相对定量分析;
步骤 (5) 免疫细胞极性化分布特征的分析,包括对微环境中能够与 肿瘤上皮细胞共定位的 CTL 细胞、NK 细胞、M2 巨噬细胞、B 细胞、Treg 细胞各自所占比率进行分析,以及对微环境中与 NK 细胞、NKT 细胞共定位 的 CTL 细胞所占比率和与 Treg 细胞、M2 巨噬细胞共定位的 B 细胞所占比 率进行分析。
2.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (2) 中, 染色组合分为2 个,第一个的组合为 DAPI/PanCK/HER2/CD3/CD8/CD56,用 于定位细胞核、胃粘膜上皮细胞、HER2 表达阳性上皮细胞、CTL 细胞、NK 细胞、NKT 细胞;第二个的组合为 DAPI/PanCK/HER2/CD20/CD163/Foxp3, 用于定位细胞核、胃粘膜上皮细胞、HER2 表达阳性上皮细胞、B淋巴细胞、 M2 巨噬细胞、Treg 细胞。
3.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (4) 中, 将癌变区域拆分为 Her2 表达阳性区域,Her2 表达阴性区域,间质区域。
4.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (2) 中 使用mIHC 技术对胃癌样本进行多重荧光染色。
5.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (3) 中, 使用PolarisSystem 对免疫荧光标记后的切片样本进行全景扫描。
6.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (4) 中, 使用 InForm细胞分析软件对癌变区域的图像进行亚微结构的精细拆分、 细胞类型区别、蛋白Marker表达相对定量分析。
7.根据权利要求 1 所述的分析方法,其特征在于,所述步骤 (1) 中, 所述病理切片厚度为 4 微米。
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