[发明专利]与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918及应用和专用引物有效
申请号: | 202111315880.8 | 申请日: | 2021-11-08 |
公开(公告)号: | CN113881802B | 公开(公告)日: | 2022-05-06 |
发明(设计)人: | 张晓芬;耿三省;陈斌;杜和山;王怡心 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 | 代理人: | 荣红颖 |
地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 控制 辣椒 果实 vc 含量 基因 连锁 snp 分子 标记 kq8 3918 应用 专用 引物 | ||
1.一种KASP特异性引物,用于鉴定辣椒果实Vc含量高低,所述特异性引物包括第一正向引物、第二正向引物和通用反向引物,
第一正向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.1所示;
第二正向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.2所示;
通用反向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.3所示。
2.根据权利要求1所述KASP特异性引物,其特征在于,所述第一正向引物和第二正向引物的5’端分别连有不同的荧光接头序列。
3.根据权利要求2所述KASP特异性引物,其特征在于,所述荧光接头序列选择FAM、HEX、FITC、RED、TET、JOE、R110中的一种。
4.一种试剂盒,包括权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物和PCR反应试剂。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应试剂为Touch-down PCR反应试剂。
6.权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物、或者权利要求4-5任一项所述的试剂盒在以下任一方面的应用:
(a)辅助选育高果实Vc含量的辣椒品种;
(b)鉴定辣椒果实Vc含量高低。
7.一种鉴定辣椒果实Vc含量高低的方法,包括如下步骤:
待测样品基因组DNA的提取;
以待测样品基因组DNA为模板,利用权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物进行PCR扩增;
对扩增产物进行荧光检测和分析,获得待测样品的基因型,由此确定待测样品果实Vc含量的水平;
当基因型为G:G和A:G时,待测样品为高果实Vc含量品种;当基因型为A:A时,待测样品为低果实Vc含量品种。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件依次为:94℃预变性15分钟;在94℃下变性20s;61℃-55℃下退火60s,共10个循环,61℃为第一个循环的退火温度,之后每个循环退火温度降低0.6℃;94℃变性20s;55℃复性/延伸60s,共26个循环。
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