[发明专利]与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918及应用和专用引物有效

专利信息
申请号: 202111315880.8 申请日: 2021-11-08
公开(公告)号: CN113881802B 公开(公告)日: 2022-05-06
发明(设计)人: 张晓芬;耿三省;陈斌;杜和山;王怡心 申请(专利权)人: 北京市农林科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 代理人: 荣红颖
地址: 100097 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 控制 辣椒 果实 vc 含量 基因 连锁 snp 分子 标记 kq8 3918 应用 专用 引物
【权利要求书】:

1.一种KASP特异性引物,用于鉴定辣椒果实Vc含量高低,所述特异性引物包括第一正向引物、第二正向引物和通用反向引物,

第一正向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.1所示;

第二正向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.2所示;

通用反向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.3所示。

2.根据权利要求1所述KASP特异性引物,其特征在于,所述第一正向引物和第二正向引物的5’端分别连有不同的荧光接头序列。

3.根据权利要求2所述KASP特异性引物,其特征在于,所述荧光接头序列选择FAM、HEX、FITC、RED、TET、JOE、R110中的一种。

4.一种试剂盒,包括权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物和PCR反应试剂。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应试剂为Touch-down PCR反应试剂。

6.权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物、或者权利要求4-5任一项所述的试剂盒在以下任一方面的应用:

(a)辅助选育高果实Vc含量的辣椒品种;

(b)鉴定辣椒果实Vc含量高低。

7.一种鉴定辣椒果实Vc含量高低的方法,包括如下步骤:

待测样品基因组DNA的提取;

以待测样品基因组DNA为模板,利用权利要求1-3任一项所述的KASP特异性引物进行PCR扩增;

对扩增产物进行荧光检测和分析,获得待测样品的基因型,由此确定待测样品果实Vc含量的水平;

当基因型为G:G和A:G时,待测样品为高果实Vc含量品种;当基因型为A:A时,待测样品为低果实Vc含量品种。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件依次为:94℃预变性15分钟;在94℃下变性20s;61℃-55℃下退火60s,共10个循环,61℃为第一个循环的退火温度,之后每个循环退火温度降低0.6℃;94℃变性20s;55℃复性/延伸60s,共26个循环。

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