[发明专利]与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918及应用和专用引物

说明书

本发明属于辣椒品种选育技术领域，涉及一种与控制辣椒果实Vc含量基因紧密连锁的SNP分子标记KQ8‑3918、扩增该分子标记的专用引物、试剂盒以及他们的应用。本发明通过SLAF‑seq技术对包含252个株系的RILs群体构建辣椒高密度完全连锁遗传图谱，结合RILs各株系果实Vc含量三个季节的表型数据，将控制果实Vc含量的主效QTL定位到1号染色体，并获得紧密连锁的SNP分子标记KQ8‑3918，该标记位于1号染色体32485915bp。利用本发明分子标记开发的特异性扩增引物，可以高效、准确地鉴定辣椒材料或品种是否属于高果实Vc含量材料或品种，可显著提高育种效率。

技术领域

本发明涉及一种辣椒品种选育技术领域，特别涉及一种与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918、扩增该分子标记的专用引物、试剂盒以及他们的应用。

背景技术

辣椒是世界范围内广泛栽培的一种重要蔬菜兼经济作物，也是我国许多地区的主要经济支柱作物。随着人民生活水平的不断提高，消费者对优质农产品的需求更为迫切，蔬菜品质正受到人们越来越多的关注。辣椒品质改良已成为辣椒育种工作的重要研究课题。

辣椒是公认的果实维生素C(Vc)含量最高的蔬菜，果实Vc含量是辣椒的一个重要营养品质。然而不同辣椒品种之间果实Vc含量差异非常显著。选育果实高Vc含量的品种是辣椒品质育种的一个重要方向。常规蔬菜育种技术对目的基因型植株的选择多依赖于植株表型，而对一些诸如果实Vc含量、辣椒红素含量和辣椒碱含量等的数量性状，则无法借助植株表型对目标性状进行选择。利用分子标记辅助选择(MAS)育种技术，并与单倍体育种技术和传统育种方法相结合，可以极大地提高选择效率，大大加快材料创新和品种选育的进程，也是缩小我国与发达国家之间辣椒育种差距的必由之路。然而，辣椒参与果实Vc生物合成、循环、降解的代谢途径尚未明确，对辣椒果实Vc的研究也仅限于遗传规律等方面，分子水平研究进展缓慢。迄今还没有可用于选育高果实Vc含量辣椒品种的分子标记，因此，开发与控制辣椒辣椒果实Vc含量基因紧密连锁的分子标记，建立分子标记辅助育种技术体系，对加快高果实维生素C含量辣椒品种的选育尤为重要。

发明内容

针对现有技术的缺陷，本发明的目的之一在于提供一种与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918。该分子标记为高Vc含量辣椒品种的选育提供了新得途径。

本发明的目的之二在于提供一种用于扩增与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918或用于确定SNP分子标记KQ8-3918对应的基因型的KASP特异性引物。

本发明的目的之三在于提供一种包含上述KASP特异性引物的试剂盒。

本发明的目的之四在于提供上述SNP分子标记KQ8-3918、KASP特异性引物以及试剂盒的应用。

本发明的目的之五在于提供一种鉴定辣椒果实Vc含量高低的方法。

为了实现上述目的，本发明采用了以下技术方案：

第一方面，本发明提供一种与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918，所述分子标记位于1号染色体的32485915bp处，碱基为A或G；所述分子标记对应的基因型：G:G和A:G为辣椒高果实Vc含量的基因型；A:A为辣椒低果实Vc含量的基因型。

第二方面，本发明还提供一种KASP特异性引物，用于扩增与控制辣椒果实Vc含量基因连锁的SNP分子标记KQ8-3918或用于确定SNP分子标记KQ8-3918对应的基因型，所述特异性引物包括第一正向引物、第二正向引物和通用反向引物。

优选地，本发明所述KASP特异性引物，第一正向引物的碱基序列如序列表SEQ IDNO.1所示；第二正向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.2所示；通用反向引物的碱基序列如序列表SEQ ID NO.3所示。