[发明专利]一种检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸,以及含有该寡核苷酸的试剂盒及应用在审
申请号: | 202111324425.4 | 申请日: | 2021-11-10 |
公开(公告)号: | CN113832262A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 葛以跃;崔仑标;刘丹丹;迟莹;朱小娟;吴涛;吴斌;赵康辰;乔乔;陈银;朱宝立 | 申请(专利权)人: | 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 南京乐羽知行专利代理事务所(普通合伙) 32326 | 代理人: | 朱磊 |
地址: | 210009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 新型 冠状病毒 感染性 寡核苷酸 以及 含有 试剂盒 应用 | ||
1.一种检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸,包括上、下游引物和荧光标记探针,所述上下游引物分别为
上游引物 5′-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3′;
下游引物 5′-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3′;
所述荧光标记探针为:5′-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG -3′,所述荧光标记探针的5′端标记FAM荧光基团,3′端标记BHQ1荧光基团。
2.一种含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒为PMA-qRT-PCR试剂盒,所述试剂盒包括以下组分,叠氮溴化丙锭溶液PMA,磷酸盐缓冲盐溶液PBS,RNA提取试剂,扩增反应液,阳性质控品,作为阴性对照的灭菌去离子水。
3.根据权利要求2所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒,其特征在于:以20%二甲基亚砜配制叠氮溴化丙锭溶液,所述叠氮溴化丙锭溶液的浓度为2mM。
4.根据权利要求2所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒,其特征在于:所述扩增反应液为1.25×,含有One Step PrimeScript III RT-qPCR Mix、上下游引物浓度为0.25μM、Taqman探针浓度为0.25μM。
5.根据权利要求2所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒,其特征在于:所述阳性质控品为灭活的新型冠状病毒或假病毒;所述假病毒质控品通过基因扩增、质粒构建和包装制备而成,合成的基因包括新型冠状病毒RdRp基因,采用数字PCR对灭活的新型冠状病毒或假病毒质控品进行定值,并稀释至500拷贝/ml,分装后-20℃保存。
6.一种含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒的应用,包括以下步骤:
第一步、样本PMA预处理;
第二步、用RNA提取试剂提取样本中总RNA;
第三步、配制qRT-PCR反应体系,将第二步提取得到的总RNA作为模板加入到装有扩增反应液的PCR管中;
第四步、将上述配制的qRT-PCR反应体系置于荧光定量PCR仪中进行PCR扩增反应;
第五步、结果判断。
7.根据权利要求6所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒的应用,其特征在于:所述第一步中,将PMA加入到待测样本中使其终浓度为200μM,同时取等量PBS加入到待测样本中作为未处理对照组,并做好标记,以同样的方法对阳性质控品进行PMA预处理;将所有样本管混合均匀,室温孵育10min;孵育完成后使用BLU-V曝光系统或卤素灯曝光15min,曝光条件为650W,样品置于冰上,距离灯源20cm。
8.根据权利要求6所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒的应用,其特征在于:所述第三步中,qRT-PCR反应体系的配制,取5μl第二步提取得到的总RNA作为模板加入到装有20μl扩增反应液的PCR管中,同时取5μl阴性对照加入到PCR管中。
9.根据权利要求6所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒的应用,其特征在于:所述第四步中,PCR扩增反应条件为52℃ 5 min;95℃ 10 sec; 95℃ 5 sec,60℃ 30 sec,共40个循环;在每个循环结束时收集FAM荧光信号。
10.根据权利要求6所述含有检测新型冠状病毒感染性的寡核苷酸的试剂盒的应用,其特征在于:所述第五步中,试剂盒质控标准为阴性对照无扩增曲线;新型冠状病毒阳性质控品PBS处理组出现典型S型扩增曲线,Ct值小于40,且质控品PBS处理组Ct值和PMA预处理组Ct值之间存在统计学差异,阴性结果Ct值记为40;当以上对照不成立时,此次实验视为无效;在符合质控标准下进行结果判断,阴性结果Ct值记为40,当样本PMA预处理组Ct值和未处理对照组Ct值之间无统计学差异,则提示样本中的新型冠状病毒具有感染性的可能性较大;当PMA预处理组Ct值和未处理对照组Ct值之间存在统计学差异,则提示样本中的新型冠状病毒无感染性或者感染性较低。
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