[发明专利]NECTIN家族和类NECTIN分子在低级别胶质瘤预后模型中的应用

权利要求书

1.一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

（1）获取单元：获取待测样本中与低级别胶质瘤患者预后相关的生物标志物的数据；

（2）处理单元：将（1）中获取的数据导入至预先建立的预后模型中，计算出的风险评分；

（3）预测单元：通过单因素与多因素Cox回归分析和生存分析对风险评分进行预后分析，获得待测样本低级别胶质瘤预后参数。

2.根据权利要求1所述的一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测方法，其特征在于，步骤（1）中所述的与低级别胶质瘤患者预后相关的生物标志物的数据为NECTIN家族和类NECTIN的表达水平。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述NECTIN家族和类NECTIN包括CADM2、NECTIN1、NECTIN2和PVR。

4.根据权利要求1所述的一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测方法，其特征在于，步骤（2）中所述风险评分公式为：风险评分=−0.386*CADM2+−0.659*NECTIN1+0.538*NECTIN2+0.746*PVR。

5.根据权利要求1所述的一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测方法，其特征在于，步骤（3）中所述预后参数预后生存风险分组，和/或指定年限的生存概率值。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述指定年限的生存概率值包括：预后生存期为半年、一年和三年的概率值。

7.一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预后模型的构建方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

（1）从癌症基因组图谱TCGA，中国胶质瘤基因组图谱CGGA以及Rembrandt图谱中寻找NECTIN基因家族和类Nectin分子中与胶质瘤临床特征的关系；

（2）使用R包survival，在（1）所述的三个数据库中分别将患者按照基因的表达水平分为高、低两组，P 0 .05作为筛选预后相关基因的截止值，筛选出CADM2、NECTIN1、NECTIN2和PVR作为预后相关基因，用于构建预后模型；

（3）使用L1-penalized Coxproportional hazards regression方法建立（2）中筛选出的四个预后相关的基因模型，并在（1）所述的三个数据库中根据基因模型计算出的风险评分，将LGG患者分为高风险组与低风险组；

（4）使用单因素对风险评分进行预后分析，可以作为低级别胶质瘤的独立预后因素；使用R包ROC计算在多个时间点曲线下面积AUC，以评估预后模型辨别能力。

8.一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测装置，其特征在于，所述装置包括：

存储器；

通信接口；

处理器，配置为执行以下步骤：

S1获取待测样本中与低级别胶质瘤患者预后相关的生物标志物的数据；

S2将S1中获取的数据导入至预先建立的预后模型中，计算出的风险评分；

S3通过单因素与多因素Cox回归分析和生存分析对风险评分进行预后分析，获得待测样本低级别胶质瘤预后参数。

9.根据权利要求8所述一种低级别胶质瘤预后总体生存期的预测装置，其特征在于，所述处理器进一步配置为执行如权利要求2-6任一项所述的方法。