[发明专利]一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用有效

专利信息
申请号: 202111344786.5 申请日: 2021-11-15
公开(公告)号: CN113789388B 公开(公告)日: 2022-03-25
发明(设计)人: 张良禄;周俊;董兰兰;吴志诚;熊杨辉;万康康;李婷婷 申请(专利权)人: 苏州艾米森生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 黄燕
地址: 215300 江苏省苏州市昆*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 食管癌 基因 甲基化 水平 检测 试剂 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种试剂,其特征在于,其包括如下至少一种的核酸组合:核酸组合1、核酸组合2、核酸组合3、核酸组合4、核酸组合5和核酸组合6;

所述核酸组合1的碱基序列如SEQ ID NO.1-3所示,所述核酸组合2的碱基序列如SEQID NO.4-6所示,所述核酸组合3的碱基序列如SEQ ID NO.7-9所示,所述核酸组合4的碱基序列如SEQ ID NO.10-12所示,所述核酸组合5的碱基序列如SEQ ID NO.13-15所示,所述核酸组合6的碱基序列如SEQ ID NO.16-18所示;区域所在位置参考的人类基因组版本号为GRCh38.p13。

2.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述试剂包括如下至少一种的核酸组合:核酸组合2和核酸组合4。

3.一种试剂盒,其特征在于,其包括权利要求1或2所述的试剂。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的检测样本为组织样本、血液样本或食管来源的细胞样本;

所述血液样本选自血浆样本、血清样本或全血样本。

5.用于检测OTOP2基因CpG岛甲基化水平的核酸组合在制备产品中的应用,其特征在于,所述产品的用途为如下中的至少一种:

诊断或辅助诊断食管癌或癌前病变;

区分食管癌样本和非癌样本;所述产品选自如下产品中的至少一种:试剂、试剂盒、芯片和测序文库;

所述OTOP2基因甲基化水平为OTOP2基因中如下至少一种CpG岛区域的甲基化水平:区域1、区域2、区域3、区域4、区域5和区域6;

其中,所述区域1选自Chr17:74923881-74924015正链,所述区域2选自Chr17:74924159-74924335正链,所述区域3选自Chr17:74924422-74924581正链,所述区域4选自Chr17:74924603-74924449负链,所述区域5选自Chr17:74924425-74924297负链,所述区域6选自Chr17:74924080-74923981负链;区域所在位置参考的人类基因组的版本号为GRCh38.p13。

6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述OTOP2基因甲基化水平为OTOP2基因中如下至少一种CpG岛区域的甲基化水平:区域2和区域4。

7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述核酸组合选自如下核酸组合中的至少一种:用于检测所述区域1的核酸组合1、用于检测所述区域2的核酸组合2、用于检测所述区域3的核酸组合3、用于检测所述区域4的核酸组合4、用于检测所述区域5的核酸组合5和用于检测所述区域6的核酸组合6;

所述核酸组合1的碱基序列如SEQ ID NO.1-3所示,所述核酸组合2的碱基序列如SEQID NO.4-6所示,所述核酸组合3的碱基序列如SEQ ID NO.7-9所示,所述核酸组合4的碱基序列如SEQ ID NO.10-12所示,所述核酸组合5的碱基序列如SEQ ID NO.13-15所示,所述核酸组合6的碱基序列如SEQ ID NO.16-18所示。

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