[发明专利]一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用有效
申请号: | 202111344786.5 | 申请日: | 2021-11-15 |
公开(公告)号: | CN113789388B | 公开(公告)日: | 2022-03-25 |
发明(设计)人: | 张良禄;周俊;董兰兰;吴志诚;熊杨辉;万康康;李婷婷 | 申请(专利权)人: | 苏州艾米森生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 黄燕 |
地址: | 215300 江苏省苏州市昆*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 食管癌 基因 甲基化 水平 检测 试剂 及其 应用 | ||
1.一种试剂,其特征在于,其包括如下至少一种的核酸组合:核酸组合1、核酸组合2、核酸组合3、核酸组合4、核酸组合5和核酸组合6;
所述核酸组合1的碱基序列如SEQ ID NO.1-3所示,所述核酸组合2的碱基序列如SEQID NO.4-6所示,所述核酸组合3的碱基序列如SEQ ID NO.7-9所示,所述核酸组合4的碱基序列如SEQ ID NO.10-12所示,所述核酸组合5的碱基序列如SEQ ID NO.13-15所示,所述核酸组合6的碱基序列如SEQ ID NO.16-18所示;区域所在位置参考的人类基因组版本号为GRCh38.p13。
2.根据权利要求1所述的试剂,其特征在于,所述试剂包括如下至少一种的核酸组合:核酸组合2和核酸组合4。
3.一种试剂盒,其特征在于,其包括权利要求1或2所述的试剂。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的检测样本为组织样本、血液样本或食管来源的细胞样本;
所述血液样本选自血浆样本、血清样本或全血样本。
5.用于检测OTOP2基因CpG岛甲基化水平的核酸组合在制备产品中的应用,其特征在于,所述产品的用途为如下中的至少一种:
诊断或辅助诊断食管癌或癌前病变;
区分食管癌样本和非癌样本;所述产品选自如下产品中的至少一种:试剂、试剂盒、芯片和测序文库;
所述OTOP2基因甲基化水平为OTOP2基因中如下至少一种CpG岛区域的甲基化水平:区域1、区域2、区域3、区域4、区域5和区域6;
其中,所述区域1选自Chr17:74923881-74924015正链,所述区域2选自Chr17:74924159-74924335正链,所述区域3选自Chr17:74924422-74924581正链,所述区域4选自Chr17:74924603-74924449负链,所述区域5选自Chr17:74924425-74924297负链,所述区域6选自Chr17:74924080-74923981负链;区域所在位置参考的人类基因组的版本号为GRCh38.p13。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述OTOP2基因甲基化水平为OTOP2基因中如下至少一种CpG岛区域的甲基化水平:区域2和区域4。
7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述核酸组合选自如下核酸组合中的至少一种:用于检测所述区域1的核酸组合1、用于检测所述区域2的核酸组合2、用于检测所述区域3的核酸组合3、用于检测所述区域4的核酸组合4、用于检测所述区域5的核酸组合5和用于检测所述区域6的核酸组合6;
所述核酸组合1的碱基序列如SEQ ID NO.1-3所示,所述核酸组合2的碱基序列如SEQID NO.4-6所示,所述核酸组合3的碱基序列如SEQ ID NO.7-9所示,所述核酸组合4的碱基序列如SEQ ID NO.10-12所示,所述核酸组合5的碱基序列如SEQ ID NO.13-15所示,所述核酸组合6的碱基序列如SEQ ID NO.16-18所示。
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