[发明专利]一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用

说明书

本发明公开了一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用，涉及癌症诊断技术领域。本发明提出了一种新的具有食管癌特异性的DNA甲基化分子标志物，通过检测OTOP2基因的甲基化水平，可以对食管癌进行特异性诊断。对于提高食管癌早期诊疗效果和降低死亡率均有重要的临床应用价值和社会意义。

技术领域

本发明涉及癌症诊断技术领域，具体而言，涉及一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用。

背景技术

食管癌是一种全球范围内常见的恶性肿瘤，每年导致超过 40万人死亡。食管癌分为两种主要的组织病理学亚型：食管鳞状细胞癌（鳞癌）和食管腺癌，二者具有不同的起源细胞、流行病学和肿瘤分子生物学。食管鳞状细胞癌主要来源于食道的鳞状上皮细胞，食管腺癌起源于胃食管交界处的腺细胞，并与食管下段胃酸反流有关。二者的流行病学特征也不同，全球约有 79% 的食管鳞状细胞癌病例发生在东南亚和中亚，也存在于非洲东南部和南美洲，食管腺癌主要流行与欧洲、北美和大洋洲。食管鳞状上皮内瘤变与食管鳞癌的发生密切相关，属于鳞癌的癌前病变，Barrett食管相关异性增生则是腺癌的癌前病变。

目前，超过90%的食管癌患者确诊时已发展至中晚期，总体5年生存率不到20%，而仅累及粘膜层和粘膜下浅层的早期食管癌通常可经内镜下微创治疗根治，患者的5年生存率可＞95%。因此，癌症的早期发现、早期诊断和早期治疗是降低死亡率、提高生存率的主要策略。

内镜和活检病理检查是目前诊断早期食管癌的金标准，但内镜检查需要做镜前准备，且操作复杂，需要专业的技术人员，有侵入性，可能会使用到麻醉剂，因此不适合大规模人群筛查，食管癌检测亟需无创检测方法。

人体血液中存在循环游离 DNA (cfDNA)，血液中cfDNA来源于凋亡、坏死的细胞或外泌体分泌等，研究发现，癌症患者血液样本中的cfDNA 含量高于健康个体的血液样本，肿瘤来源的cfDNA，称为循环肿瘤 DNA（ctDNA），ctDNA中含有肿瘤特异性的遗传改变和表观遗传学改变，可以用作癌症检测的标志物。其中，DNA甲基化水平异常是癌症发生的早期事件，可以用于早期食管癌检测。由于cfDNA在血液中具有含量少、提取困难、存在周期短等缺点，且血液中的cfDNA 来源于全身各个组织，很多标记物在多种类型的癌症中均会出现甲基化异常，因此寻求肿瘤特异性的甲基化标记物充满挑战，目前尚缺乏可用于食管癌检测的血液甲基化标志物。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种食管癌基因甲基化水平检测试剂及其应用以解决上述技术问题。

DNA甲基化是基因上重要的一种化学修饰，影响着基因转录的调控过程和细胞核结构。DNA甲基化的改变是癌症发展的早期事件和伴随事件，主要体现在肿瘤组织上抑癌基因的高甲基化和原癌基因的低甲基化等。而且DNA甲基化较稳定，如果可以发现肿瘤特异的血液DNA甲基化分子标志物则有巨大的临床应用价值。

基于此，本发明特提出了一种新的具有食管癌特异性的DNA甲基化分子标志物，通过检测OTOP2基因的甲基化水平，可以对食管癌进行特异性诊断。对于提高食管癌早期诊疗效果和降低死亡率均有重要的临床应用价值和社会意义。

本发明是这样实现的：

本发明提供了一种用于检测OTOP2基因甲基化水平的物质在制备产品中的应用，产品的用途为如下中的至少一种：

诊断或辅助诊断食管癌或癌前病变；

区分食管癌样本和非癌样本。

OTOP2基因编码Otopetrin-2蛋白，目前关于OTOP2基因CpG岛甲基化与食管癌的关系尚未被现有技术报道。仅有研究表明Otopetrin-2蛋白在结直肠癌组织中的表达下调。