[发明专利]应用于核酸检测的Crispr/LbCas12a突变体蛋白及其制备方法和应用在审
申请号: | 202111354374.X | 申请日: | 2021-11-16 |
公开(公告)号: | CN114214348A | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 焦健;郑先波;冯建灿;黄松;白团辉;宋春辉;王苗苗;宋尚伟;庞宏光;杨孟莉;李明 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/55;C12N15/10;C12N9/22;C12Q1/6816 |
代理公司: | 郑州优盾知识产权代理有限公司 41125 | 代理人: | 冉珊敏 |
地址: | 450002 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 应用于 核酸 检测 crispr lbcas12a 突变体 蛋白 及其 制备 方法 应用 | ||
1.应用于核酸检测的Crispr/LbCas12a突变体蛋白的制备方法,其特征在于,步骤如下:
(1)将编码野生型LbCas12蛋白的全长基因插入pET-N-His-TEV载体的
(2)根据编码突变后的LbCas12a蛋白的核苷酸序列,针对D156R、G532R、K538V、Y542R和K595R五个突变位点设计引物,进行PCR定点突变;
(3)回收步骤(2)的PCR定点突变产物,插入到步骤(1)构建的pET-LbCas12a-wt载体中,得到LbCas12a-5M原核表达质粒;
(4)步骤(3)的LbCas12a-5M原核表达质粒经转化、表达、纯化得到Crispr/LbCas12a突变体蛋白。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于:所述步骤(2)中编码突变后的野生型LbCas12蛋白的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述步骤(2)中扩增D156R、G532R、K538V、Y542R和K595R五个突变位点的PCR引物对分别为:D156R-F/D156R-R、G532R-F/G532R-R、K538V@Y542R-F/ K538V@Y542R-R以及K595R-F/K595R-R;其中D156R-F序列如SEQID No.2所示、D156R-R序列如SEQ ID No.3所示、G532R-F序列如SEQ ID No.4所示、G532R-R序列如SEQ ID No.5所示、K538V@Y542R-F序列如SEQ ID No.6所示、K538V@Y542R-R序列如SEQ ID No.7所示、K595R-F序列如SEQ ID No.8所示、K595R-R序列如SEQ ID No.9所示。
4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述步骤(4)中Crispr/LbCas12a突变体蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.10所示。
5.权利要求1-4任一项所述的制备方法所制备的Crispr/LbCas12a突变体蛋白。
6.权利要求5所述的Crispr/LbCas12a突变体蛋白在反式切割非常规dsDNA靶标片段中的应用。
7.权利要求5所述的Crispr/LbCas12a突变体蛋白在反式切割含有TTTN PAM的dsDNA靶标片段中的应用。
8.权利要求5所述的Crispr/LbCas12a突变体蛋白在识别并反式切割含有TNTN PAM的dsDNA靶标片段中的应用。
9.根据权利要求6-7任一项所述的应用,其特征在于,步骤如下:
(1)以50μL为体积标准将终浓度为100 nM的Crispr/LbCas12a突变体蛋白和120 nMcrRNA预先混合并在25 ℃下预孵育10 min,形成crRNA/Crispr/LbCas12a复合物;将待测DNA靶标用退火处理形成两个互补DNA寡核苷酸;
(2)步骤(1)的crRNA/Crispr/LbCas12a复合物、两个互补DNA寡核苷酸、400 nM ssDNAFQ-reporter、20 U RNase抑制剂、20nM dsDNA激活剂、5 μL 10×NEBuffer 3.1混匀并添加ddH2O至50 μL为反应体系,进行反式切割活性测定。
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