[发明专利]真核细胞S-腺苷甲硫氨酸浓度感知荧光报告系统有效
申请号: | 202111427318.4 | 申请日: | 2021-11-26 |
公开(公告)号: | CN114149976B | 公开(公告)日: | 2023-08-11 |
发明(设计)人: | 杨鹏;王译萱;高倩倩 | 申请(专利权)人: | 同济大学 |
主分类号: | C12N5/10 | 分类号: | C12N5/10;C12N15/867;C12N15/65;C12N15/31;C12N15/10;C12Q1/02;G01N21/64 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 陆惠中 |
地址: | 200092 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 真核细胞 腺苷 甲硫氨酸 浓度 感知 荧光 报告 系统 | ||
1.一种实时感知真核细胞SAM浓度的系统,其特征在于,构建方法为:
分别构建AAVS1_Hygro_CMV_3nat_EGFP和AAVS1_Hygro_CMV_NS44_RFP载体,利用CRISPR-Cas9体系特异剪切人类第19号染色体上的AAVS1位点,将两条供体片段整合到基因组上的安全位点;所述的3nat序列为SEQ ID NO:4,所述的NS44序列为 SEQ ID NO:9;所述SAM为S-腺苷甲硫氨酸;
通过潮霉素B药物筛选实现等位基因定点插入,并通过RCR鉴定和DNA测序获得定点插入的细胞系;
在所述的细胞系中,通过病毒包装系统,过表达KRAB MetJ表达载体,以此构建SAM浓度感知双荧光报告系统;
所述构建病毒包装系统的方法为通过KRAB MetJ-PCW57.1质粒与 P/G质粒,VSVG质粒,进行三质粒瞬转,培养后后产生慢病毒,利用此病毒感染所述细胞系。
2.根据权利要求1所述的实时感知真核细胞SAM浓度的系统,其中,所述的细胞系为HEK293T。
3.一种SAM浓度检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-2任一项所述的实时感知真核细胞SAM浓度的系统。
4.一种筛选调控SAM代谢的基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:
根据权利要求1-2任一项所述的系统构建稳定表达Cas9蛋白的细胞系,使用GeCKO慢病毒文库进行全基因组范围的筛选;
通过病毒感染sgRNA质粒文库后敲除基因,通过流式细胞分选获得不同集群,通过PCR特异地扩增出不同集群的基因序列信息,将来自功能性筛选富集获得的细胞和未经过处理的原文库细胞的PCR扩增序列,通过深度测序分析及比较,可以获得被富集的sgRNA序列信息以及其所对应的基因,依次获得调控SAM代谢的潜在基因。
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