[发明专利]用于预测酪氨酸激酶抑制剂耐药的标志物在审
申请号: | 202111439315.2 | 申请日: | 2021-11-30 |
公开(公告)号: | CN113999912A | 公开(公告)日: | 2022-02-01 |
发明(设计)人: | 常鹏;曹震;杨承刚;李昭然 | 申请(专利权)人: | 青岛泱深生物医药有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16C20/50 |
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地址: | 266000 山东省青岛市崂山区科苑纬*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 预测 酪氨酸 激酶 抑制剂 耐药 标志 | ||
1.一种标志物,其特征在于,所述的标志物包括LASP1、REEP5和/或BTNL3。
2.一种试剂,所述的试剂包括能够检测样本中权利要求1所述的标志物表达水平的试剂,优选的,所述的样本为细胞,优选的,所述的细胞为CD34+细胞。
3.根据权利要求2所述的试剂,其特征在于,所述的试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术来测量生物标志物表达水平的试剂,
优选的,所述的试剂包括:
与所述生物标志物基因特异性结合的引物或探针;
与所述生物标志物蛋白特异性结合的抗体、肽、适配体或化合物。
4.如下任一项所述的应用:
(1)权利要求1所述的标志物在构建预测慢性粒细胞白血病患者对酪氨酸激酶抑制剂敏感性的系统中的应用;
(2)权利要求2或3所述的试剂在制备预测慢性粒细胞白血病患者对酪氨酸激酶抑制剂敏感性的产品中的应用;
优选的,所述的酪氨酸激酶抑制剂包括Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂、血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂,优选的,所述的酪氨酸激酶抑制剂为Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂,优选的,所述的Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂包括伊马替尼、达沙替尼、尼洛替尼、AZD9291,优选的,所述的Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂为伊马替尼。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的产品包括试剂盒、芯片。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述的试剂盒还包括CD34+细胞免疫磁珠,优选的,所述的试剂盒还包括骨髓单个核细胞分离试剂。
7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述的芯片包括基因芯片、蛋白质芯片。
8.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的系统包括:
1)检测单元:包括生物标志物检测模块;
2)分析单元:将检测单元检测得到的生物标志物的表达水平作为输入变量,输入预测慢性粒细胞白血病患者是否对酪氨酸激酶抑制剂耐药的模型进行分析;
3)评估单元:输出样本对应的受试者对酪氨酸激酶抑制剂耐药的风险值;
所述的生物标志物包括LASP1、REEP5和/或BTNL3。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述的模型使用选自以下一种或更多种算法来确定:XGBoost、随机森林、glmnet、cforest、机器学习的分类与回归树、treebag、K-毗邻、神经网络、支持向量机径向、支持向量机线性、朴素贝叶斯或多层感知。
10.一种筛选能提高慢性粒细胞白血病患者对酪氨酸激酶抑制剂敏感度的药物的方法,所述方法包括:
1)在测试组中,向待测对象施用待测试药物,检测测试组中来源于所述对象的样品中生物标志物的表达水平V1;在对照组中,向待测对象施用空白对照,检测对照组中来源于所述对象的样品中生物标志物的表达水平V2;
2)比较上一步骤检测得到的水平V1和水平V2,从而确定所述测试化合物是否是能提高慢性粒细胞白血病患者对酪氨酸激酶抑制剂敏感度的候选药物;
所述的生物标志物包括LASP1、REEP5和/或BTNL3;
优选的,所述的酪氨酸激酶抑制剂包括Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂、血管内皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂,优选的,所述的酪氨酸激酶抑制剂为Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂,优选的,所述的Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂包括伊马替尼、达沙替尼、尼洛替尼、AZD9291,优选的,所述的Bcr/Abl酪氨酸激酶抑制剂为伊马替尼。
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