[发明专利]一种基于适配体结合crispr-cas12f1检测金黄色葡萄球菌的方法在审
申请号: | 202111454054.1 | 申请日: | 2021-12-01 |
公开(公告)号: | CN116256509A | 公开(公告)日: | 2023-06-13 |
发明(设计)人: | 韦阳道;杨治庆;万逸;肖云祥;申逸;孙跃 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | G01N33/569 | 分类号: | G01N33/569;G01N21/64 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 570228 海南省*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 适配体 结合 crispr cas12f1 检测 金黄色 葡萄球菌 方法 | ||
1.一种核酸适配体结合cas12f1酶检测金黄色葡萄球菌(S.aureus)的方法,其特征在于:核酸适配体单链DNA(Aptamer,45 nt)与靶单链DNA(Blocker,21 nt)杂交形成双寡核酸链,加入金黄色葡萄球菌后,适配体核酸链与病原微生物结合并解离出靶单链DNA,最终靶单链DNA为Cas12f1蛋白的激活底物并引发反式切割单链DNA探针,通过探针荧光信号强度的变化进而获得高特异性与高灵敏度的检测。
2.按权利要求1所述的一种cas12f1检测金黄色葡萄球菌的方法,其特征在于:核酸适配体Aptamer设计,其序列为TCCCACGATCTCATTAGTCTGTGGATAAGCGTGGGACGTCTATGA。
3.按权利要求1所述的一种cas12f1检测金黄色葡萄球菌的方法,其特征在于:Blocker设计,其序列为CAGACTAATGAGATCGTGGGA。
4.按权利要求1所述的一种cas12f1检测金黄色葡萄球菌的方法,其特征在于,包括下列步骤:
(1) Aptamer与Blocker加入到杂交缓冲液(50 mM HEPES (pH7.4), 500 mM NaCl,0.05% t吐温 20)中,95℃加热15min,冷却至室温;
(2)将待测菌液加入Aptamer与Blocker的杂交溶液中,室温反应3h;反应结束后12000rpm/min离心2min;取上清加入到Cas12f1荧光检测体系中,37℃下反应2h,激发波长为492nm,发射波长为520nm条件下,测定上述体系荧光强度;其中,Aptamer,Blocker序列杂交缓冲液和Cas12f1如权利要求1-3任一项所述。
5.按权利要求1所述的一种cas12f1检测金黄色葡萄球菌的方法,其特征在于:病原微生物,包括伤寒沙门菌(E.typhi),肺炎克雷伯菌(K.pneumonia),铜绿假单胞菌(K.pneumonia),金黄色葡萄球菌(S.aureus),单增李斯特(L.monocytogenes)和酿脓链球菌(S.pyogenes)。
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