[发明专利]鉴别无籽油棕的SSR标记引物、应用及方法有效

专利信息
申请号: 202111470335.6 申请日: 2021-12-03
公开(公告)号: CN113981131B 公开(公告)日: 2023-06-20
发明(设计)人: 石鹏;张大鹏;王永 申请(专利权)人: 中国热带农业科学院椰子研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 海口翔翔专利事务有限公司 46001 代理人: 张耀婷
地址: 571339 *** 国省代码: 海南;46
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摘要:
搜索关键词: 鉴别 油棕 ssr 标记 引物 应用 方法
【权利要求书】:

1.鉴别无籽油棕的SSR标记引物,其特征在于:包括两对引物组,分别为P16和P19;所述P16引物的正向引物的序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物的序列如SEQ ID NO.2所示,所述P19引物的正向引物的序列如SEQ ID NO.3所示,反向引物的序列如SEQ ID NO.4所示。

2.根据权利要求1所述的鉴别无籽油棕的SSR标记引物在育苗阶段对油棕的无籽性状进行早期鉴定中的应用。

3.一种利用权利要求1所述的SSR标记引物鉴别无籽油棕的方法,其特征在于,步骤如下:

步骤S1,取0.05-0.1g油棕叶片提取基因组DNA,稀释浓度到200ng/µl;

步骤S2,配制20ul反应体系对DNA进行PCR扩增,扩增方式为梯度降落法,扩增条件为:94˚C变性5 min,94˚C变性30s,退火温度从65˚ 降到56˚C,运行10个循环,每个循环降低1 ˚C,55˚C退火25个循环,每个循环45 s,72˚C延伸1 min,最后72˚C 延伸10 min,之后4˚C保存;

步骤S3,PCR产物中加入1µl 6×染料混合,取0.8-1.0 µl混合液,在6%聚丙烯酰胺凝胶上点样,电泳后银染,观察250-500bp之间的条带情况进行无籽油棕鉴定:250-500bp之间有条带的为有籽油棕,没有条带的为无籽油棕;

步骤S2中,反应体系包含1µl 基因组DNA,0.4 µl dNTPs,2 µl含有MgCl2的10×RealTimes buffer,2 µl RealTimes Taq DNA聚合酶 5 U µl-1,0.8 µl正向引物 10 µM,0.8 µl反向引物10 µM,13 µl灭菌超纯水。

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