[发明专利]一种东星斑抗病良种培育的基因组选择方法在审
| 申请号： | 202111478938.0 | 申请日： | 2021-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN114015789A | 公开（公告）日： | 2022-02-08 |
| 发明（设计）人： | 陈松林;卢昇;刘洋;周茜;王磊;朱春华;张天时;陈亚东;徐文腾 | 申请（专利权）人： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所;南方海洋科学与工程广东省实验室（湛江） |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京识然知识产权代理事务所(普通合伙) 11975 | 代理人： | 曾庆国 |
| 地址： | 266071 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 东星斑 抗病 良种 培育 基因组 选择 方法 | ||
1.一种东星斑抗病良种培育的基因组选择方法，其特征在于，所述的方法包括如下步骤：
1)使用不同地理来源的东星斑幼鱼构建东星斑抗病参考群体，将具有抗病表型、但未纳入参考群体的个体作为验证群体；
2)对参考群体和验证群体进行全基因组重测序，捕获基因组范围内高质量单核苷酸多态性SNP位点；
3)通过比较基因组最佳线性无偏预测G-BLUP和BayesCπ两种方法预测抗病性状基因组估计育种值GEBV的准确性随SNP标记数减少的变化趋势来挑选预测验证个体GEBV的SNP数目和预测方法；
4)根据步骤3)得到的结果，选出用于计算东星斑验证群体GEBV的SNP标记，
5)利用步骤4)中挑选出的SNP位点和构建好的东星斑抗病参考群体预测验证群体的抗病GEBV，若存活的验证个体的平均GEBV大于死亡个体的平均GEBV则表明GEBV与个体的抗病力存在正相关关系，GEBV高的个体抗病力也强，用GEBV对备选亲本进行挑选，获得抗病力强的个体用于抗病良种培育。
2.如权利要求1所述的基因组选择方法，其特征在于，所述的1)中用于构建抗病参考群体的东星斑幼鱼是通过抗病力筛选后获得的。
3.如权利要求1所述的基因组选择方法，其特征在于，所述的SNP标记包含了与东星斑抗病性状相关的SNP位点。
4.如权利要求3所述的基因组选择方法，其特征在于，所述的与东星斑抗病相关的SNP位点位于序列为SEQ ID No：1—30中任一个序列的第36位。
5.一种与东星斑抗病相关的SNP位点，其特征在于，所述的SNP位点位于序列为SEQ IDNo：1—30中任一个序列的第36位。
6.权利要求5所述的SNP位点在筛选抗病东星斑亲本中的应用。
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