[发明专利]检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法及其应用

权利要求书

1.一种检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，所述检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法包括以下步骤：

步骤一，以西农萨能奶山羊的血液以及耳组织全基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过QPCR扩增DGAT1基因的CNV区域；

步骤二，将MC1R基因作为参照，根据2^-ΔΔCt法将西农萨能奶山羊结果分为插入型、缺失型和正常型；

步骤三，根据定量结果鉴定西农萨能奶山羊DGAT1基因的拷贝数变异。

2.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤一中，所述引物对P1的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，所述引物对P2的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。

3.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤一中，所述基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为157bp，基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为267bp。

4.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤一中，所述QPCR所用的扩增体系包括：50ng/μL模板DNA1μL、10pM的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各1μL以及2×SYBR Green QPCR Mix 10μL。

5.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤一中，所述QPCR所用的反应程序为：(1)预变性：95℃，30s；(2)扩增反应：95℃变性10s，60℃退火30s，39个循环。

6.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤一中，所述DGAT1基因的CNV区域位于DGAT1基因参考基因组序列MC1R，包含于CNVR9。

7.如权利要求1所述的检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法，其特征在于，步骤二中，所述的拷贝数变异是根据2^-ΔΔCt将定量结果分为三类：插入型，2^-ΔΔCt2；缺失型，2^-ΔΔCt2；正常型，2^-ΔΔCt＝2。

8.一种如权利要求1所述检测西农萨能奶山羊DGAT1基因CNV标记的方法在西农萨能奶山羊分子标记辅助选择育种中的应用。

9.如权利要求8所述的在西农萨能奶山羊分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于，所述具有缺失型拷贝数变异类型的个体在产奶质量上较优。

10.如权利要求8所述的在西农萨能奶山羊分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于，所述产奶质量指标，包括乳脂含量、蛋白质含量、乳糖含量、总固体含量、总固体酸度、乳固体非脂肪含量、凝固点降低和乳密度。