[发明专利]特异性分子靶标及其检测金黄色葡萄球菌ST型的方法在审
申请号: | 202111520970.0 | 申请日: | 2021-12-13 |
公开(公告)号: | CN114196767A | 公开(公告)日: | 2022-03-18 |
发明(设计)人: | 吴清平;周宝青;叶青华;王楚芳;代京莎;陈玲;张菊梅;丁郁;陈谋通;薛亮;王涓;吴诗;蔡淑珍;杨宁;陈惠元 | 申请(专利权)人: | 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心);广东环凯生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/686;C12N15/11;C12N1/20;C12R1/445 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫;周全英 |
地址: | 510000 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性 分子 靶标 及其 检测 金黄色 葡萄球菌 st 方法 | ||
1.用于检测金黄色葡萄球菌的特异性分子靶标,其特征在于,所述分子靶标为:
(a)如SEQ ID NO:1~6所述的任意一种或几种核苷酸序列;或者,
(b)在(a)中的核苷酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个核苷酸且与(a)中核苷酸具有90%以上同源性的核苷酸序列。
2.检测如权利要求1所述的特异性分子靶标的引物组,其特征在于,所述引物组为:
针对如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组1包括:如SEQ ID NO:7所示的正向引物和如SEQ ID NO:8所示的反向引物;
针对如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组2包括:如SEQ ID NO:9所示的正向引物和如SEQ ID NO:10所示的反向引物;
针对如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组3包括:如SEQ ID NO:11所示的正向引物和如SEQ ID NO:12所示的反向引物;
针对如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组4包括:如SEQ ID NO:13所示的正向引物和如SEQ ID NO:14所示的反向引物;
针对如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组5包括:如SEQ ID NO:15所示的正向引物和如SEQ ID NO:16所示的反向引物;
针对如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列扩增的PCR引物组6包括:如SEQ ID NO:15所示的正向引物和如SEQ ID NO:16所示的反向引物。
3.一种金黄色葡萄球菌,其特征在于,是(a)、(b)或(c);
(a)金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST7,含有如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;
(b)金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST188,含有如SEQ ID NO:3或SEQ IDNO:4所示的核苷酸序列;
(c)金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST398,含有如SEQ ID NO:4或SEQ IDNO:5所示的核苷酸序列。
4.如权利要求1所述的特异性分子靶标或权利要求2所述的引物组在筛查金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST型试剂中的应用。
5.如权利要求2所述的引物组在鉴别金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST型中的应用。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST型包括:ST7、ST188、ST398。
7.一种用于鉴别金黄色葡萄球菌ST型的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、使用如权利要求2所述的引物组对样品或待测菌的基因组DNA进行PCR扩增;
S2、观察扩增产物是否出现目的条带,如果出现目的条带则判定该样品含有三种金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)ST7、ST188、ST398中的一种。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,步骤S1中,PCR扩增体系包括:PCR反应缓冲液、Tag酶、任一权利要求2所述的引物组、dNTP、MgCl2、模板DNA和灭菌双蒸水。
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