[发明专利]一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒、其制备方法与应用有效
申请号: | 202111590131.6 | 申请日: | 2021-12-23 |
公开(公告)号: | CN114317686B | 公开(公告)日: | 2023-08-11 |
发明(设计)人: | 宋春元;汪联辉;张晶晶 | 申请(专利权)人: | 南京邮电大学 |
主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;C12Q1/682;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 曹翠珍 |
地址: | 210009 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr cas13a 系统 sers 检测 试剂盒 制备 方法 应用 | ||
1.一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒,其特征在于,包括CRISPR/Cas13a系统、枝状杂交链式反应体系和SERS检测芯片三部分;
所述CRISPR/Cas13a系统包括Cas13a蛋白、crRNA和尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP;
所述枝状杂交链式反应体系包括修饰有染料分子ROX的发夹型DNA单链H1,发夹型DNA单链H2和H3;
所述SERS检测芯片为表面修饰有捕获单链C的银纳米棒阵列基片;
所述crRNA碱基序列如SEQ ID NO:2所示:
crRNA:5’- GAC CAC CCC AAA AAU GAA GGG GAC UAA AAC CUA CCU GCA CUG UAA GCACUU UU -3’;
所述尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的碱基序列如SEQ ID NO:3所示:
RP:5’-ACT ACC ATG ATC /rU//rU//rU/ /rU//rU//rU/ GTT AGA TCT CCA GTT ATCATG GTA GTT GGA -3’;
所述发夹型DNA单链H1的碱基序列如SEQ ID NO:4所示:
H1:5’- ROX- TCC AGT TAT CAT GTT AAG CGA TGA TAA CTG GAG ATC TAA C -3’;
所述发夹型DNA单链H2的碱基序列如SEQ ID NO:5所示:
H2:5’- CGC TTA ACA TGA TAA CTG GAG TTA GAT CTC CAG TTA TCA TTG CGG TGACAC GGC AGT TAG A -3’;
所述发夹型DNA单链H3的碱基序列如SEQ ID NO:6所示:
H3:5’- TCT AAC TGC CGT GTC ACC GCA GTT AGA TCT CCA GTT ATC AT -3’;
所述捕获单链C的碱基序列如SEQ ID NO:7所示:
C:5’- SH-(CH2)6 -TTT TTT TTT TTC CAA CTA CC -3’。
2.权利要求1所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(一)CRISPR/Cas13a系统的制备:包括Cas13a蛋白、crRNA和尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的制备;
所述Cas13a蛋白与crRNA的浓度为0.1~1 μM,所述尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的浓度为1~10 μM;
(二)枝状杂交链式反应体系的制备:包括修饰有染料分子ROX的发夹型DNA单链H1,发夹型DNA单链H2和H3的制备;
所述的发夹型DNA单链H1、H2和H3的浓度为5~20 μM;
(三)SERS检测芯片制备:
(1)制备银纳米棒阵列并用DEPC处理水多次冲洗;
(2)将银纳米棒阵列和20 μL 0.5~2 μM 捕获单链C溶液共培养,捕获单链C通过巯基与银形成共价键而固定在银纳米棒阵列表面;
培养条件:25~37℃,60~80%湿度环境中静置3~5小时;
(3)使用反应缓冲液清洗基片后,将20 μL 1~100 μM 6-巯基己醇滴加至上述基片表面置于37℃恒温混匀仪中反应20分钟;
(4)依次用反应缓冲液和DEPC处理水多次清洗基片,得到SERS检测芯片。
3.根据权利要求2所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒的制备方法,其特征在于:反应缓冲液是10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,pH 8.3。
4.权利要求1所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒用于检测血清中微小核酸microRNA的应用,所述的应用是非疾病诊断目的的。
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