[发明专利]一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒、其制备方法与应用有效

专利信息
申请号: 202111590131.6 申请日: 2021-12-23
公开(公告)号: CN114317686B 公开(公告)日: 2023-08-11
发明(设计)人: 宋春元;汪联辉;张晶晶 申请(专利权)人: 南京邮电大学
主分类号: C12Q1/6837 分类号: C12Q1/6837;C12Q1/682;C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 曹翠珍
地址: 210009 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 crispr cas13a 系统 sers 检测 试剂盒 制备 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒,其特征在于,包括CRISPR/Cas13a系统、枝状杂交链式反应体系和SERS检测芯片三部分;

所述CRISPR/Cas13a系统包括Cas13a蛋白、crRNA和尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP;

所述枝状杂交链式反应体系包括修饰有染料分子ROX的发夹型DNA单链H1,发夹型DNA单链H2和H3;

所述SERS检测芯片为表面修饰有捕获单链C的银纳米棒阵列基片;

所述crRNA碱基序列如SEQ ID NO:2所示:

crRNA:5’- GAC CAC CCC AAA AAU GAA GGG GAC UAA AAC CUA CCU GCA CUG UAA GCACUU UU -3’;

所述尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的碱基序列如SEQ ID NO:3所示:

RP:5’-ACT ACC ATG ATC /rU//rU//rU/ /rU//rU//rU/ GTT AGA TCT CCA GTT ATCATG GTA GTT GGA -3’;

所述发夹型DNA单链H1的碱基序列如SEQ ID NO:4所示:

H1:5’- ROX- TCC AGT TAT CAT GTT AAG CGA TGA TAA CTG GAG ATC TAA C -3’;

所述发夹型DNA单链H2的碱基序列如SEQ ID NO:5所示:

H2:5’- CGC TTA ACA TGA TAA CTG GAG TTA GAT CTC CAG TTA TCA TTG CGG TGACAC GGC AGT TAG A -3’;

所述发夹型DNA单链H3的碱基序列如SEQ ID NO:6所示:

H3:5’- TCT AAC TGC CGT GTC ACC GCA GTT AGA TCT CCA GTT ATC AT -3’;

所述捕获单链C的碱基序列如SEQ ID NO:7所示:

C:5’- SH-(CH2)6 -TTT TTT TTT TTC CAA CTA CC -3’。

2.权利要求1所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:

(一)CRISPR/Cas13a系统的制备:包括Cas13a蛋白、crRNA和尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的制备;

所述Cas13a蛋白与crRNA的浓度为0.1~1 μM,所述尿嘧啶修饰的发夹型识别单链RP的浓度为1~10 μM;

(二)枝状杂交链式反应体系的制备:包括修饰有染料分子ROX的发夹型DNA单链H1,发夹型DNA单链H2和H3的制备;

所述的发夹型DNA单链H1、H2和H3的浓度为5~20 μM;

(三)SERS检测芯片制备:

(1)制备银纳米棒阵列并用DEPC处理水多次冲洗;

(2)将银纳米棒阵列和20 μL 0.5~2 μM 捕获单链C溶液共培养,捕获单链C通过巯基与银形成共价键而固定在银纳米棒阵列表面;

培养条件:25~37℃,60~80%湿度环境中静置3~5小时;

(3)使用反应缓冲液清洗基片后,将20 μL 1~100 μM 6-巯基己醇滴加至上述基片表面置于37℃恒温混匀仪中反应20分钟;

(4)依次用反应缓冲液和DEPC处理水多次清洗基片,得到SERS检测芯片。

3.根据权利要求2所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒的制备方法,其特征在于:反应缓冲液是10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,pH 8.3。

4.权利要求1所述的一种基于CRISPR/Cas13a系统的SERS检测试剂盒用于检测血清中微小核酸microRNA的应用,所述的应用是非疾病诊断目的的。

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