[发明专利]用于食管癌分型的生物标志物及其应用

权利要求书

1.一种用于食管癌分型的生物标志物，其特征在于，包括以下基因中的至少5种：TP53、NFE2L2、NOTCH1、RUNX1T1、LRP1B、ERBB4、MUC16、PTPRD、PREX2、ERBB2、CDKN2A、NBEA、APC、ARID1A、SMAD4、ROBO2、PTPRC、NRG1、RGPD3、TNFAIP3、PDGFRB、WWOX、SMAD4、SRC、MAFB、PTPRT、SETBP1、PML、IDH2、BLM、FES、CHD2、FLCN、MAP2K1、SMAD3、ASXL1、GAS7、MAP2K4、TCF12、SDC4、CRTC3、PTK6、SS18L1、GNAS、NFATC2、SALL4、LRP1B、FOXP1、SRGAP3、VHL、PIK3CA、RHOA、TBL1XR1、NCKIPSD、MITF、FANCD2、FBLN2、MLF1、ROBO2、SOX2、MB21D2、XPC、GMPS、SETD2、WWTR1、MAP3K13、TP63、TFRC、BAP1、MECOM、EPHA3、RAF1、MLH1、CTNNB1、IGF2BP2、ETV5、MUC4、CACNA1D、PPARG、MYD88、EIF4A2、BCL6、PBRM1、TGFBR2、ERBB4、LPP、ATR、CCR4。

2.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，以基因突变发生频率为分型依据的生物标志物包括以下基因中的至少5种：TP53、NFE2L2、NOTCH1、RUNX1T1、LRP1B、ERBB4、MUC16、PTPRD、PREX2、ERBB2、CDKN2A、NBEA、APC、ARID1A、SMAD4、ROBO2、PTPRC、NRG1、RGPD3、TNFAIP3、PDGFRB；以拷贝数变异发生频率为分型依据的生物标志物包括以下基因中的至少5种：LRP1B、FOXP1、SRGAP3、VHL、PIK3CA、RHOA、TBL1XR1、NCKIPSD、MITF、FANCD2、FBLN2、MLF1、ROBO2、SOX2、MB21D2、XPC、GMPS、SETD2、WWTR1、MAP3K13、TP63、TFRC、BAP1、MECOM、EPHA3、RAF1、MLH1、CTNNB1、IGF2BP2、ETV5、MUC4、CACNA1D、PPARG、MYD88、EIF4A2、BCL6、PBRM1、TGFBR2、ERBB4、LPP、ATR、CCR4、WWOX、SMAD4、SRC、MAFB、PTPRT、SETBP1、PML、IDH2、BLM、FES、CHD2、FLCN、MAP2K1、SMAD3、ASXL1、GAS7、MAP2K4、TCF12、SDC4、CRTC3、PTK6、SS18L1、GNAS、NFATC2、SALL4。

3.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物包括以下基因：GAS7、LRP1B、MAP2K4、FOXP1和WWOX。

4.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物包括以下基因：TP63、FLCN、MB21D2、MITF、SOX2、GAS7、LRP1B、MAP2K4、FOXP1和WWOX。

5.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物包括以下基因：ETV5、SMAD4、ROBO2、TFRC、TBL1XR1、ERBB4、GMPS、PIK3CA、PPARG、RAF1、TP63、FLCN、MB21D2、MITF、SOX2、GAS7、LRP1B、MAP2K4、FOXP1和WWOX。

6.权利要求1-5中任一项所述生物标志物在开发和/或制备用于食管鳞癌和食管腺癌分型诊断产品中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述生物标志物作为生物样本检测中的生物标志物，所述生物样本取自：血液或组织中的至少一种。

8.一种用于食管癌分型诊断的试剂盒，其特征在于，该试剂盒包括检测生物样本中权利要求1-5中任一项所述生物标志物的试剂。