[发明专利]一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统

权利要求书

1.一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统，包括：

第一获取单元，用于获取待筛选的生物活性成分的结构文件及信息，所述信息包括生物活性成分的类别及大小；

选择单元，用于根据所述信息将待筛选的生物活性成分的结构文件输入相应的分子对接模块，所述分子对接模块包括蛋白-蛋白分子对接模块、蛋白-大核酸分子对接模块、蛋白-小核酸分子对接模块、蛋白-小分子分子对接模块；

第二获取单元，用于获取病毒结构蛋白的结构文件；

匹配单元，用于将所述病毒结构蛋白的结构文件与待筛选的生物活性成分的结构文件匹配到同一分子对接模块；

分子对接单元，用于将所述分子对接模块识别病毒结构蛋白的结合位点和待筛选的生物活性成分的三维构象，完成病毒蛋白与待筛选的生物活性成分结合及排序；

可视化单元，用于根据所述排序得到排名靠前的病毒蛋白与待筛选的生物活性成分结合后的复合物并进行三维可视化展示。

2.根据权利要求1所述的基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选系统，其特征在于，所述系统还包括蛋白结构预测单元，所述蛋白结构预测单元位于第二获取单元前，当原始输入文件是病毒结构蛋白的核酸序列或氨基酸序列时，所述蛋白结构预测单元用于将病毒结构蛋白的核酸序列或氨基酸序列生成病毒结构蛋白的结构文件，优选的，所述蛋白结构预测单元为alphafold或rosettafold软件。

3.一种基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选方法，包括：

获取待筛选的生物活性成分的结构文件及信息，所述信息包括生物活性成分的类别及大小；

根据所述信息将待筛选的生物活性成分的结构文件输入相应的分子对接模块，所述分子对接模块包括蛋白-蛋白分子对接模块、蛋白-大核酸分子对接模块、蛋白-小核酸分子对接模块、蛋白-小分子分子对接模块；

获取病毒结构蛋白的结构文件；

将所述病毒结构蛋白的结构文件与待筛选的生物活性成分的结构文件匹配到同一分子对接模块；

所述分子对接模块识别病毒结构蛋白的结合位点和待筛选的生物活性成分的三维构象，完成病毒蛋白与待筛选的生物活性成分结合及排序；

根据所述排序得到排名靠前的病毒蛋白与待筛选的生物活性成分结合后的复合物并进行三维可视化展示。

4.根据权利要求1所述的基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选方法，其特征在于，所述生物活性成分的类别包括蛋白、核酸、小分子；

可选的，当待筛选的生物活性成分为蛋白时，所述待筛选的生物活性成分的结构文件属于蛋白-蛋白分子对接模块；当待筛选的生物活性成分为小分子时，将所述待筛选的生物活性成分的结构文件输入蛋白-小分子分子对接模块；当待筛选的生物活性成分为核酸时，根据核酸大小将所述待筛选的生物活性成分的结构文件输入蛋白-小核酸分子对接模块或蛋白-大核酸分子对接模块。

5.根据权利要求1所述的基于病毒结构蛋白的生物活性成分筛选方法，其特征在于，获取病毒结构蛋白的结构文件后对所述病毒蛋白的结构文件进行预处理，所述预处理包括加氢、计算电荷、去水分子、去杂原子、将非标准氨基酸转换成标准氨基酸、结构完整性检查和/或结构修复；优选的，所述结构修复包括对结构蛋白残缺或断裂部分进行连接；

可选的，所述将待筛选的生物活性成分的结构文件输入相应的分子对接模块前对所述待筛选的生物活性成分的结构文件进行预处理，所述预处理包括加氢、加电荷、化学键、优化氢的取向、检查有无原子缺失、有无侧链缺失。