[发明专利]一种基于高通量测序技术的芽孢杆菌种水平鉴别方法

权利要求书

1. 一种非诊断目的的鉴定芽孢杆菌的方法，其特征在于，以sigA基因为标记物，以SEQID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，扩增获得标记物基因片段的菌株为芽孢杆菌；所述标记物的基因片段大小为461~493 bp。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述的扩增是以含有微生物基因组的样品为模板，进行扩增。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述样品包括基因组DNA、菌悬液或单菌落。

4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述扩增是以含待测混合物的基因组DNA为模板进行扩增。

5. 一种鉴定复杂样品中芽孢杆菌种水平组成的方法，其特征在于，所述方法包括：（1）构建芽孢杆菌sigA基因数据库；（2）以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，对样品基因组中sigA基因序列进行扩增；（3）将步骤（2）扩增结果回收、测序；（4）将测序结果与步骤（1）构建的芽孢杆菌sigA基因数据库比对，鉴定、分析样品中芽孢杆菌种水平的组成特征；所述芽孢杆菌sigA基因标数据库含有Genbank数据库中可检索到的芽孢杆菌sigA序列；

所述方法不以疾病的诊断为目的。

6. 一种鉴定芽孢杆菌种的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含SEQ ID NO.1和SEQID NO.2所示的引物对。

7. 一种筛选芽孢杆菌的方法，其特征在于，从待筛选的样品中提取基因组DNA，再以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，利用菌液对sigA基因的序列进行扩增，扩增获得大小为461~493 bp基因片段的菌株为芽孢杆菌；

或者，将待筛选的样品制成菌悬液，将菌悬液稀释、涂布于固体培养基上培养至形成单菌落，对长出的单菌落进行摇瓶得到菌液，再以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，利用菌液对sigA基因的序列进行扩增，扩增获得大小为461~493 bp基因片段的菌株为芽孢杆菌；

所述方法不以疾病的诊断为目的。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述培养基包括NB营养肉汁培养基或LB肉汤培养基。