[发明专利]用于调整训练门以适应流式细胞仪数据的方法和系统在审
申请号: | 202180011892.3 | 申请日: | 2021-01-21 |
公开(公告)号: | CN115176139A | 公开(公告)日: | 2022-10-11 |
发明(设计)人: | 艾利森·欧文;尼古拉·沙穆西克;约瑟夫·T·特罗特 | 申请(专利权)人: | 贝克顿·迪金森公司 |
主分类号: | G01N15/14 | 分类号: | G01N15/14;G01N33/49 |
代理公司: | 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 | 代理人: | 程强;谢攀 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 调整 训练 适应 细胞 数据 方法 系统 | ||
提供了用于调整从第一组流式细胞仪数据制备的训练门以适应第二组流式细胞仪数据的方法。在实施例中,方法包括为第一组流式细胞仪数据和第二组流式细胞仪数据中的每个生成图像。在一些情况下,生成图像包括将数据组织到二维箱中,并为每个箱分配阴影,使得箱由像素表示。在一些情况下,方法包括用计算机实施的算法扭曲所述第一组流式细胞仪数据的所生成的图像,使得其最大化相对于所述第二组流式细胞仪数据的相似度,并将相同的变换应用于训练门。在一些实施例中,方法包括将经调整的训练门叠加到所述第二组流式细胞仪数据的所生成的图像上。还提供了用于调整训练门的系统和计算机可读介质。
相关申请的交叉引用
本申请与2020年1月31日提交的美国临时申请序列号62/968,520和2020年7月9日提交的美国临时申请序列号63/049,735相关,其公开内容通过引用并入本文。
背景技术
流式细胞术是一种用于表征和经常用于分类生物材料(例如血液样品的细胞或另一种类型的生物或化学样品中的所关注的颗粒)的技术。流式细胞仪通常包括用于接收流体样品(例如血液样品)的样品容器和包含鞘液的鞘容器。流式细胞仪将流体样品中的颗粒(包括细胞)作为细胞流传输至流动池,同时还将鞘液引导至流动池。为了表征流动流的成分,用光照射流动流。流动流中材料的变化(例如形态或荧光标记的存在)可能会导致观察到的光中的变化,这些变化允许表征和分离。例如,流体悬浮中的诸如分子、分析物结合的珠子或个体细胞的颗粒通过检测区域,在该检测区域中,颗粒暴露于通常来自一种或多个激光器的激励光,并且测量颗粒的光散射和荧光特性。颗粒或其成分通常用荧光染料标记以方便检测。通过使用光谱不同的荧光染料来标记不同的颗粒或成分,可以同时检测多种不同的颗粒或成分。在一些实施方式中,分析器中包括多个检测器,对于待测量的散射参数中的每个有一个检测器,对于待检测的不同染料中的每个有一个或更多个检测器。例如,一些实施例包括光谱配置:其中,每种染料使用多于一个的传感器或检测器。获得的数据包括对于光散射检测器中的每个测量的信号和荧光发射。
流式细胞仪还可以包括用于记录测量数据和分析数据的装置。例如,可以使用连接到检测电子设备的计算机来执行数据存储和分析。例如,数据能够以表格形式存储,其中,每一行对应于一种颗粒的数据,而列对应于所测量的特征中的每个。使用诸如“FCS”文件格式的标准文件格式以用于存储来自颗粒分析仪的数据方便使用单独的程序和/或机器来分析数据。使用当前的分析方法,数据通常显示为一维直方图或二维(2D)图,以便于可视化,但也可以使用其它方法来可视化多维数据。
使用例如流式细胞仪测量的参数通常包括由颗粒沿着主要前向方向以窄角散射的激励波长的光(称为前向散射(FSC))、由颗粒在与激励激光器正交的方向上散射的激励光(称为侧向散射(SSC)),以及由在光谱波长范围上或通过主要在具体检测器或检测器阵列中检测的荧光染料来测量信号的一个或更多个检测器中的荧光分子发射的光。不同的细胞类型能够通过它们的光散射特性和由用荧光染料标记的抗体或其它荧光探针标记各种细胞蛋白或其它成分而产生的荧光发射来识别。
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