[发明专利]与疆南绒山羊羊绒纤维直径及其变异系数相关的分子标记及特异性引物对和应用

权利要求书

1.一种与疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状相关的分子标记，其特征在于其位于疆南绒山羊1号染色体的KRTAP27-1基因上，KRTAP27-1基因位于1号染色体核苷酸序列的第3968645bp-3969193bp处，所述分子标记位于1号染色体核苷酸序列的3968799bp处，突变碱基为A或G。

2.一种用于扩增权利要求1所述的与疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状相关的分子标记的特异性引物对，其特征在于包括上游引物和下游引物；

上游引物：5’-agtggcgtatcctacagaactcact-3’；

下游引物：5’-cgctactcaggctcctcctg-3’。

3.一种权利要求2所述的特异性引物对在制备体外检测与疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状相关的分子标记的试剂或试剂盒的应用。

4.一种权利要求1所述的分子标记在疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状选择中的应用。

5.根据权利要求4所述的分子标记在疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状选择中的应用，其特征在于包括下述步骤：第一步，取待测疆南绒山羊的基因组DNA；第二步，以基因组DNA为模板，利用特异性引物对进行第一轮扩增，第一轮PCR体系为25μl的反应体系，第一轮PCR体系由下列成分组成：

第一轮PCR扩增条件为：98度预变性3分钟，然后执行8个循环，循环条件是94度变性30秒，50度退火30秒，72度延伸30秒；紧接着执行25个循环，循环条件是98度变性30秒，66度退火30秒，72度延伸30秒；最后72度延伸5分钟，PCR反应完成后，4度保温；

上游引物池：5’-agtggcgtat cctacagaac tcact-3’；

下游引物池：5’-cgctactcag gctcctcctg-3’；

第三步，以第一轮PCR产物为模板执行第二轮PCR反应，第二轮PCR体系为30μl的反应体系，第二轮PCR体系由下列成分组成：

第二轮PCR扩增条件为：98度预变性5分钟，然后执行5个循环，循环条件是变性94度30秒，55度退火20秒，72度延伸30秒，最终72度延伸5分钟，PCR反应完成后，4度保温，各个PCR产物等量混合后，进行测序，根据测序结果进行基因分型；

对于羊绒纤维直径性状，所述分子标记对应的基因型中，含有G基因的GG或GA基因型的疆南绒山羊属于羊绒纤维直径性状较细的优势个体；对于羊绒纤维直径变异系数性状，所述分子标记对应的基因型中，AA基因型疆南绒山羊属于羊绒纤维直径变异系数性状较小的优势个体。