[发明专利]与疆南绒山羊羊绒纤维直径及其变异系数相关的分子标记及特异性引物对和应用

说明书

本发明涉及动物分子标记技术领域，是一种与疆南绒山羊羊绒纤维直径及其变异系数相关的分子标记及特异性引物对和应用，该与疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数相关的分子标记位于疆南绒山羊1号染色体的KRTAP27‑1基因上，KRTAP27‑1基因位于1号染色体核苷酸序列的第3968645bp‑3969193bp处，所述分子标记位于1号染色体核苷酸序列的3968799bp处，突变碱基为A或G。本发明所述分子标记能够实现羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状优良品种种羊的早期选种，出生后即可进行选留，从而降低选育成本，加速高品质超细型绒山羊的育种进程，为疆南绒山羊的遗传改良提供理论基础和指导。

技术领域

本发明涉及动物分子标记技术领域，是一种与疆南绒山羊羊绒纤维直径及其变异系数性状相关的分子标记及其特异性引物对，所述变异系数是指纤维直径变异系数，所述特异性引物对在制备体外检测与疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状相关的分子标记的试剂或试剂盒的应用，以及所述分子标记在疆南绒山羊羊绒纤维直径及纤维直径变异系数性状选择中的应用。

背景技术

随着人民生活水平日益提高，越来越多的人不仅注重服饰的款式与舒适感，更注重其生态与保健性。集华丽、高贵、轻薄、柔软、舒适与保健为一体的羊绒制品无疑会受到更多人的青睐。

2020年，疆南绒山羊是经历40年的培育而形成的绒山羊新品种，拥有生产性能高、耐粗饲等优良特性。疆南绒山羊生态坏境恶劣，核心育种基地(新疆阿克苏综合试验站)位于东经79°47′，北纬41°23′，海拔2000米的干旱荒漠、半荒漠草场上。年均气温6.5℃，降雨量200毫米。90％的草场为荒漠草场，植被覆盖率约10％至30％。

但近几年随着羊肉价格的冲击和基层育种工作的懈怠，疆南绒山羊存在原有细绒资源流失的现象，严重影响了羊绒品质，影响绒销售价格。而这些绒山羊养殖是当地牧民主要的经济来源。山羊绒的价格受到绒色泽和细度的影响，在同色系的羊绒中，纤维直径越细价格越高。年龄、性别和饲养管理均能影响绒山羊绒纤维直径。但除了这些因素外，遗传才是左右羊绒细度的根本原因。种业是现代羊产业发展的基石，遗传改良是提高羊产业竞争力的关键。绒山羊新品种的育成和推广应用成为这些人民群众立足当地资源脱贫致富的重要途径。选育适应新疆等极端地方气候的超细型绒山羊是当地迫切急需的任务。因此寻求一种有效、便捷，并且能够在短时间内加速绒山羊育种进程的育种手段便显得尤为重要。

经典的育种方法主要是通过杂交，但该方法遗传进展较慢、育种周期较长。随着分子生物学理论和技术的快速发展，分子遗传学和基因工程方法与传统的标记辅助选择方法相结合，为育种问题提供了更好的解决方案。寻找羊绒性状相关的遗传标记是我们最先关注的方向。

目前针对纤维直径性状，在中国主要的绒山羊品种，如辽宁绒山羊、内蒙古绒山羊和西藏绒山羊都进行了转录组学的研究。基因组方面，主要采取全基因组关联性分析、候选基因多态性分析等研究策略挖掘绒山羊绒纤维直径相关的基因和分子标记。而疆南绒山羊新品种审定后，关于羊绒性状的研究鲜有报道。

角蛋白和角蛋白关联蛋白是构成毛发的主要蛋白质。在毛发皮质中，毛发角蛋白中间丝嵌在由毛发角蛋白相关蛋白(KRTAP)组成的丝间基质中，该蛋白通过其广泛的二硫键与毛发角蛋白中丰富的半胱氨酸残基交联，对形成坚硬且有抗性的毛干至关重要。KRTAP13、KRTAP15、KRTAP24，和KRTAP27属于HS族the high sulphur(HS；≤30mol％cysteine)。由于HS蛋白在毛发中首先表达，因此大多数学者集中研究HS蛋白。有研究表明氨基酸的改变可能影响蛋白质在翻译后修饰过程中磷酸化位点的丢失与否，同时导致蛋白质的净电荷发生改变。

编码角蛋白关联的基因通常较为丰富突变，这些变异可能与绒山羊的产绒性能有关。目前，KRTAP15-，KRTAP13.1，KRTAP27-1和KRTAP24-1等基因多态性在绵、山羊中已被证实能够影响羊绒性状。但这些基因是否能够影响疆南绒山羊的羊绒纤维直径还不清楚。因此本研究分析疆南绒山羊KRTAP27-1基因多态性对羊绒纤维直径的影响，旨在为培育超细型绒山羊提供实验依据。