[发明专利]联合检测人SMN1和SMN2基因的试剂盒及其应用有效
申请号: | 202210055074.X | 申请日: | 2022-01-18 |
公开(公告)号: | CN114480620B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 胡琦;陈林丽;何小用;赵鹏;刘伟;王靖元 | 申请(专利权)人: | 无锡中德美联生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 余俊杰 |
地址: | 214174 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 联合 检测 smn1 smn2 基因 试剂盒 及其 应用 | ||
1.联合检测人SMN1和SMN2基因的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括扩增17个基因座的特异性引物,其中基因座为同时检测 SMN1和SMN2基因同源的外显子1至外显子6的以下7个基因座:Exon1、Exon2a、Exon2b、Exon3、Exon4、Exon5、Exon6;和特异性检测SMN1基因外显子7和8的以下2个基因座:SMN1-Exon7、SMN1-Exon8;和特异性检测SMN2基因外显子7和8的以下2个基因座:SMN2-Exon7、SMN2-Exon8;和检测 “2+0型”携带者相关性SNP的以下5个基因座:g.11678 GT、g.22804 GA、g.26190 AG、g.27134 TG、g.27706-27707 del AT;以及检测内参基因ACTB;
所述扩增17个基因座的特异性引物的序列如下:Exon1、SEQ ID NO.1-2;Exon2a、SEQID NO.3-4;Exon2b、SEQ ID NO.5-6;Exon3、SEQ ID NO.7-8;Exon4、SEQ ID NO.9-10;Exon5、SEQ ID NO.11-12;Exon6、SEQ ID NO.13-14;SMN1-Exon7、SEQ ID NO.15-16;SMN2-Exon7、SEQ ID NO.17-18;SMN1-Exon8、SEQ ID NO.19-20;SMN2-Exon8、SEQ ID NO.21-22;ACTB、SEQ ID NO.23-24;g.11678 GT、SEQ ID NO.25-27;g.22804 GA、SEQ ID NO.28-30;g.26190 AG、SEQ ID NO.31-33;g.27134 TG、SEQ ID NO.34-37;g.27706-27707 delAT、SEQ ID NO.38-39;其中SMN1-Exon8、SMN2-Exon8及g.27706-27707 delAT共用下游引物,g.27134 T与SMN1-Exon7共用下游引物,g.27134 G与SMN2-Exon7共用下游引物;
所述试剂盒包括一套拷贝数校准质粒,每个外显子基因座及内参基因ACTB均有对应的拷贝数校准质粒。
2.根据权利要求1所述的联合检测人SMN1和SMN2基因的试剂盒,其特征在于,所述扩增17个基因座的特异性引物的浓度如下: SEQ ID NO.1-2、0.15μM;SEQ ID NO.3-4、0.18μM;SEQ ID NO.5-6、0.18μM;SEQ ID NO.7-8、0.25μM;SEQ ID NO.9-10、0.20μM;SEQ ID NO.11-12、0.35μM;SEQ ID NO.13-14、0.20μM;SEQ ID NO.15、0.30μM;SEQ ID NO.16、0.40μM;SEQID NO.17、0.25μM;SEQ ID NO.18、0.36μM;SEQ ID NO.19、0.18μM;SEQ ID NO.20、0.35μM;SEQ ID NO.21、0.18μM;SEQ ID NO.22、0.35μM;SEQ ID NO.23-24、0.15μM;SEQ ID NO.25-27、0.20μM;SEQ ID NO.28-30、0.20μM;SEQ ID NO.31-33、0.20μM;SEQ ID NO.34、0.20μM;SEQ ID NO.35、0.40μM;SEQ ID NO.36、0.20μM;SEQ ID NO.37、0.36μM;SEQ ID NO.38、0.10μM;SEQ ID NO.39、0.35μM。
3.根据权利要求1所述的联合检测人SMN1和SMN2基因的试剂盒,其特征在于,所述特异性引物的5’端采用以下荧光染料标记:FAM、HEX、TET、TAMRA、ROX、VIC、NED、ATTO系列或CY系列。
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