[发明专利]来源于深海细菌的α-葡萄糖苷酶QsGH13的三维结构及其晶体制备和应用有效
申请号: | 202210075876.7 | 申请日: | 2022-01-23 |
公开(公告)号: | CN114774390B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 黄静;余正;翟星宇 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | C12N9/24 | 分类号: | C12N9/24;C12P7/06;G01N33/68;A23L29/00 |
代理公司: | 长沙睿翔专利代理事务所(普通合伙) 43237 | 代理人: | 周松华;孙建霞 |
地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 来源于 深海 细菌 葡萄 糖苷酶 qsgh13 三维 结构 及其 晶体 制备 应用 | ||
1.来源于深海细菌Qipengyuania seohaensis sp.SW-135的α-葡萄糖苷酶QsGH13晶体,其特征在于,其参数为:
晶体结构空间群:P 21 21 21 ;
晶胞参数:a=58.816 Å,b=129.920 Å,c=161.307 Å,α=γ=β=90°;
I/σ (I):14.36 ;
Rwork/ Rfree:0.2112 /0.2678;
分辨率范围(Å):50.00-2.20 ;
数据完整性(%):99.40 ;
所述α-葡萄糖苷酶QsGH13的序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根据权利要求1所述的晶体,其特征在于,深海细菌Qipengyuania seohaensissp.SW-135的α-葡萄糖苷酶QsGH13的晶体三维结构中,一个晶体学不对称单位有两个蛋白分子,被称为A链与B链。每个分子由20个β链和19个α螺旋组成。具体组成如下:折叠1,即含Ala11-Ile16的氨基酸区段,α螺旋1,即含Asp31-Gly46氨基酸区段,β折叠2,即含Asp48-Ser53的氨基酸区段,β折叠3,即含Phe55-Lys57的氨基酸区段,β折叠4,即含Asp69-Asp74的氨基酸区段,α螺旋2,即含 Pro75-Gly78的氨基酸区段,α螺旋3,即含Thr79-Leu93的氨基酸区段,β折叠5,即含Lys96-Gln101的氨基酸区段,α螺旋4,即含His110-Arg117的氨基酸区段,β折叠6,即含Val129-Ala131的氨基酸区段,β折叠7,即含Ala151-Asp155的氨基酸区段,β折叠8,即含Gln160-His164的氨基酸区段,α螺旋5,即含Asn177-Glu193的氨基酸区段,β折叠9,即含Asp197-Asp202的氨基酸区段,α螺旋6,即含Ala203-Ala207的氨基酸区段,α螺旋7,即含Arg228-Phe232的氨基酸区段,α螺旋8,即含Asp243-Asp256的氨基酸区段,β折叠10,即含Phe262-Val267的氨基酸区段,α螺旋9,即含Asp271-Phe279的氨基酸区段,β折叠11,即含Asn287-Tyr290的氨基酸区段,α螺旋10,即含Thr301-Glu311的氨基酸区段,β折叠12,即含Trp320-Trp323的氨基酸区段,α螺旋11,即含Ala333-Cys338的氨基酸区段,α螺旋12,即含Thr339-Leu357的氨基酸区段,β折叠13,即含Asn360-Tyr365的氨基酸区段,α螺旋13,即含Gly366-Gly370的氨基酸区段,α螺旋14,即含Asp383-Trp390的氨基酸区段,α螺旋15,即含Arg396-Arg400的氨基酸区段,α螺旋16,即含Asn426-Ser430的氨基酸区段,α螺旋17,即含Val431-Asp437的氨基酸区段,α螺旋18,即含Ser440-Asn455的氨基酸区段,α螺旋19,即含Pro456-His460的氨基酸区段,β折叠14,即含His462-Asp469的氨基酸区段,β折叠15,即含Asp471-Ala479的氨基酸区段,β折叠16,即含Gln482-Leu490的氨基酸区段,β折叠17,即含Val495-Cys497的氨基酸区段,β折叠18,即含Arg503-Ile508的氨基酸区段,β折叠19,即含Thr514-Leu516的氨基酸区段,β折叠20,即含Ala520-Glu525的氨基酸区段。
3.根据权利要求1所述的晶体,其特征在于,所述三维结构的第202位天冬氨酸、第266位谷氨酸与第329位天冬氨酸构成催化活性中心。
4.权利要求1~3中任一项所述晶体的制备方法,其特征在于,具体步骤如下:先将预先制备好的高纯度QsGH13蛋白浓缩至5~30mg/ml,接着使用结晶试剂盒作为晶体生长的初筛条件,采用悬滴气相扩散法进行结晶,得到衍射分辨率高的晶体;晶体培养在4~25℃进行,结晶液滴中蛋白溶液与结晶试剂体积比为3:1~1:3,结晶试剂的组成为:0.01~0.2 MTris-HCl,0.1~0.3 M NaCl,质量浓度5~30%的分子量为1000~10000的PEG。
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