[发明专利]用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组及应用

权利要求书

1.一种用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组，其特征在于，所述引物组包括至少8个分别扩增H7N9病毒全基因组不同区域的引物对，所述不同区域包括PB1、PB2、PA、HA、NP、NA、MP和NS。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，扩增PB1区域的引物对选自引物对1、引物对2或引物对3中的至少一种；扩增PB2区域的引物对选自引物对4、引物对5或引物对6中的至少一种；扩增PA区域的引物对选自引物对7、引物对8或引物对9中的至少一种；扩增HA区域的引物对选自引物对10、引物对11或引物对12中的至少一种；扩增NP区域的引物对选自引物对13和/或引物对14；扩增NA区域的引物对选自引物对15和/或引物对16；扩增MP区域的引物对选自引物对17、引物对18或引物对19中的至少一种；扩增NS区域的引物对选自引物对20和/或引物对21。

3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述PB1区域引物对1上游引物的特征序列包括：ATGGATGTCAATCCGACT；所述PB1区域引物对1下游引物的特征序列包括：CCAGATTGCTCAAGTTTC和/或CCAGACTGCTCAAGTTTC；所述PB1区域引物对2上游引物的特征序列包括：TCGTGTATTTTGTAGAAGC和/或TCGTGTATTTCGTAGAAGC；所述PB1区域引物对2下游引物的特征序列包括：ACTCCAAAACTGGGCAACT；所述PB1区域引物对3上游引物的特征序列包括：GCTTTTTCTACCGCTATGG；所述PB1区域引物对3下游引物的特征序列包括：CACTATTTTTGCCGTCTGA；

所述PB2区域引物对4上游引物的特征序列包括：ATGGAAAGAATAAAAGAACT；所述PB2区域引物对4下游引物的特征序列包括：TGATACAGTTGCTCTTCTAA、TGACACAGTTGCTCTTCTAA、TGATACTGTTGCTCTTCTAA、TGACACTGTTGCTCTTCTAA、TGATACAGTTGCCCTTCTAA、TGACACAGTTGCCCTTCTAA、TGATACTGTTGCCCTTCTAA或TGACACTGTTGCCCTTCTAA中至少一种；所述PB2区域引物对5上游引物的特征序列包括：AGAGTTTAATTATTGCTGCT；所述PB2区域引物对5下游引物的特征序列包括：TGTTTCACTAACCTCTTCAG、TGTTTCACTAACCTCCTCAG、TGTTTCACTAACCTCTTCGG或TGTTTCACTAACCTCCTCGG中至少一种；所述PB2区域引物对6上游引物的特征序列包括：CGTTTCTTAAGGGTTCGAG、CGTTTCTTGAGGGTTCGAG、CGTTTCTTAAGGGTCCGAG或CGTTTCTTGAGGGTCCGAG中至少一种；所述PB2区域引物对6下游引物的特征序列包括：TTAATTGATGGCCATCCGA；

所述PA区域引物对7上游引物的特征序列包括：ATGGAAGACTTTGTGCGA；所述PA区域引物对7下游引物的特征序列包括：CAATGCAGCCGTTCGGTT；所述PA区域引物对8上游引物的特征序列包括：ACCGAACTTCTCCAGCCT；所述PA区域引物对8下游引物的特征序列包括：AGTTGAAAGTCATCCATG；所述PA区域引物对9上游引物的特征序列包括：AGAGCTACTGAATATATAA、AGAGCTACTGAGTATATAA、AGAGCTACTGAATACATAA、AGAGCTACTGAGTACATAA、AGGGCTACTGAATATATAA、AGGGCTACTGAGTATATAA、AGGGCTACTGAATACATAA或AGGGCTACTGAGTACATAA中至少一种；所述PA区域引物对9下游引物的特征序列包括：TGCCACAACTATCTTAGTG；

所述HA区域引物对10上游引物的特征序列包括：ATGAACACTCAAATCCTG；所述HA区域引物对10下游引物的特征序列包括：ATTGGGATTTAGTAGTAG、ATTGGGATTTAGTATTAG、ATTGGGATTTAGCAGTAG或ATTGGGATTTAGCATTAG中至少一种；所述HA区域引物对11上游引物的特征序列包括：GAGCGAGACCACAAGTTAA；所述HA区域引物对11下游引物的特征序列包括：ATTGCTATCAAGAGTTCAG、ATTGCTATCAAGAGTTCTG、ATTGCTACCAAGAGTTCAG或ATTGCTACCAAGAGTTCTG中至少一种；所述HA区域引物对12上游引物的特征序列包括：TGTGATAAAGTGGACCAGAGAT和/或TGTGATAAATTGGACCAGAGAT；所述HA区域引物对12下游引物的特征序列包括：TTATATACAAATAGTGCACCGC；

所述NP区域引物对13上游引物的特征序列包括：ATGGCGTCTCAAGGCACCAAACGA；所述NP区域引物对13下游引物的特征序列包括：GCATTCCCAGGATTTCTGCTTTCT和/或GCATTCCCAGGATTTCTGCTCTCT；所述NP区域引物对14上游引物的特征序列包括：ATCAAGTGCGAGAAAGCAGAAATCCT、ATCAAGTGCGAGAAAGCAGAAATCCT、ATCAAGTGCGAGAGAGCAGAAACCCT或ATCAAGTGCGAGAGAGCAGAAACCCT中至少一种；所述NP区域引物对14下游引物的特征序列包括：TCAATTGTCATACTCCTCTGCATTGT；

所述NA区域引物对15上游引物的特征序列包括：ATGAATCCAAATCAGAAGA；所述NA区域引物对15下游引物的特征序列包括：AGTCAGAGACTCCCATTTT和/或AGTCAGAGACTCCCATTTC；所述NA区域引物对16上游引物的特征序列包括：CATACTAAGAACACAGGAATC和/或CATACTAAGAACACAGGAGTC；所述NA区域引物对16下游引物的特征序列包括：TTAGAGGAAGTACTCTATTTT；

所述MP区域引物对17上游引物的特征序列包括：ATGAGCCTTCTAACCGAGGTCG和/或ATGAGTCTTCTAACCGAGGTCG；所述MP区域引物对17下游引物的特征序列包括：TCTGCTCACAAGTGGCACATAC；所述MP区域引物对18上游引物的特征序列包括：ATACAAGAAACTGAAGAGGGAAATG和/或GTACAAGAAACTGAAGAGGGAAATG；所述MP区域引物对18下游引物的特征序列包括：CACAATATCAAGTGCAATATCCCAA和/或CACAATATCAGGTGCAATATCCCAA；所述MP区域引物对19上游引物的特征序列包括：ATGGTACTAGCCAGTACTAC和/或ATGGTACTAGCCAGCACTAC；所述MP区域引物对19下游引物的特征序列包括：TTACTTCAGCTCTATGTTGAC；

所述NS区域引物对20上游引物的特征序列包括：AGCAAAAGCAGGGTGACAAA和/或AGCGAAAGCAGGGTGACAAA；所述NS区域引物对20下游引物的特征序列包括：TATCATTCCATTCAAATCCACC、TATCATTCCACTCAAATCCACC、TATCATTCCATTCAAATCCTCC、TATCATTCCACTCAAATCCTCC、TATCATTCCATTCAAGTCCACC、TATCATTCCACTCAAGTCCACC、TATCATTCCATTCAAGTCCTCC或TATCATTCCACTCAAGTCCTCC中至少一种；所述NS区域引物对21上游引物的特征序列包括：CCTTCTCTTCCAGGACATACT；所述NS区域引物对21下游引物的特征序列包括：TTAAATAAGCTGAAACGAGAA。