[发明专利]基于CRISPR检测脑卒中相关TYMS基因的试剂盒在审
申请号: | 202210128252.7 | 申请日: | 2022-02-10 |
公开(公告)号: | CN114438192A | 公开(公告)日: | 2022-05-06 |
发明(设计)人: | 肖以磊;于福华;孙汉宇;刘岳飞;周杰;邢晓辉;李中辰;程诚;姚杰 | 申请(专利权)人: | 江苏博嘉生物医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/686 |
代理公司: | 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 姜婷 |
地址: | 226000 江苏省南通市崇川区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 crispr 检测 脑卒中 相关 tyms 基因 试剂盒 | ||
1.一种检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括突变型crDNA或突变型crRNA;
所述突变型crDNA包括:
rs699517突变型crDNA,其序列如SEQ ID NO.1所示;
和/或rs2790突变型crDNA,其序列如SEQ ID NO.2所示;
所述突变型crRNA包括:
rs699517突变型crRNA,其序列如SEQ ID NO.3所示;
和/或rs2790突变型crRNA,其序列如SEQ ID NO.4所示。
2.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括用于特异性扩增TYMS基因上rs699517位点的引物对:rs699517-F,其序列如SEQ ID NO.5所示,rs699517-R,其序列如SEQ ID NO.6所示;和/或用于特异性扩增TYMS基因上rs2790位点的引物对:rs2790-F,其序列如SEQ ID NO.7所示;rs2790-R,其序列如SEQ ID NO.8所示。
3.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括cas12a蛋白。
4.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括荧光探针,所述荧光探针的5’端标记有荧光报告基团,所述荧光探针的3’端标记有荧光猝灭基团。
5.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括DNA酶抑制剂。
6.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒中包括阴性对照品,所述阴性对照品为野生型crDNA或野生型crRNA:
所述野生型crDNA包括:
rs699517野生型crDNA,其序列如SEQ ID NO.9所示;
和/或rs2790野生型crDNA,其序列如SEQ ID NO.10所示;
所述野生型crRNA包括:
rs699517野生型crRNA,其序列如SEQ ID NO.11所示;
和/或rs2790野生型crRNA,其序列如SEQ ID NO.12所示。
7.如权利要求1所述检测试剂盒在检测与脑卒中相关TYMS基因突变中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述应用的过程具体为:对待测DNA样品进行PCR扩增,扩增完成后加入检测混合液反应,并采集荧光变化;所述检测混合液含有荧光探针和权利要求1所述突变型crRNA;所述突变型crDNA在T7 RNA聚合酶作用下生成RNA,经回收纯化得到对应的crRNA。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的程序为:95℃3min进行预变性;95℃10s,60℃20s,循环30次;最后降温至25℃,反应结束。
10.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述检测混合液共50uL,具体为:250~500nM纯化的cas12a蛋白,250~500nM突变型crRNA,1~5μL荧光探针,2μL DNA酶抑制剂,无酶水余量。
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