[发明专利]一种江黄颡鱼性别相关SNP分子标记及其应用

说明书

本申请公开了一种江黄颡鱼性别相关SNP分子标记及其应用。与江黄颡鱼性别相关SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示序列自5’端起100、101位碱基，分别是TC或AT，所述SNP分子标记为TC/AT杂合基因型的个体为雄性江黄颡鱼，所述SNP分子标为TC纯合基因型的个体为雌性江黄颡鱼。通过鉴别该SNP分子标记，能够快速、简便、准确鉴别江黄颡的于遗传性别，从而能够推动江黄颡鱼性别控制育种、单性养殖技术及产业发展，带来巨大的经济效益。

技术领域

本申请涉及SNP分子标记技术领域，尤其涉及一种江黄颡鱼性别相关SNP分子标记及其应用。

背景技术

黄颡鱼个体小，肉质鲜美，肌间刺少，是我国重要的水产品，近几年黄颡鱼养殖可以说非常火爆，在特种养殖领域占有很高的比重，一直保持着相对较高且稳定的市场价格和养殖效益，受到广大养殖户的追捧。2019年全国黄颡鱼养殖产量超过了50万吨，并且仍在持续增长。以江黄颡鱼为父本和黄颡鱼母本杂交而来的杂交黄颡鱼，具有生长速度快，适温范围广，饲料系数低，抗病能力强等优势，是黄颡鱼养殖的当家品种。由于雌鱼生长速度明显小于雄鱼，存在出塘鱼体规格差异大，雌鱼卖价低等问题，培育全雄杂交黄颡鱼将可以很好的解决这些问题，具有重要的经济效益。

目前，江黄颡鱼单性育种技术研究较少，国内外还没有江黄颡鱼性别特异分子标记的报道。因此开发江黄颡鱼性别特异的分子标记对于培育全雄杂交黄颡鱼具有重要的生产应用价值。

发明内容

有鉴于此，本申请的目的在于提供一种江黄颡鱼性别相关SNP分子标记及其应用，以在一定程度上解决上述技术问题之一。

第一方面，本申请实施例公开了一种江黄颡鱼性别相关SNP分子标记，所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第100、101位碱基，分别是TC或AT。

本申请实施例中，所述SNP分子标记为TC/AT杂合基因型的个体为雄性江黄颡鱼，所述SNP分子标为TC纯合基因型的个体为雌性江黄颡鱼。

第二方面，本申请实施例提供了一组用于扩增本申请第一方面SNP分子标记SEQID NO.1序列的引物对，其序列如下：

P1:如SEQ ID NO.2所示；

P2:如SEQ ID NO.3所示。

第三方面，本申请实施例提供了一种鉴定江黄颡鱼遗传性别的方法，包括以下步骤：

提取江黄颡鱼待检样本基因组DNA；

以第二方面所述引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；

对所述PCR产物进行分组后，获得分离曲线，从而鉴定江黄颡鱼雌、雄性别。

本申请实施例中，所述分离曲线为两条分开的曲线，其中一条为杂合SNP分子标记的显示结果，另一条为纯合SNP分子标记的显示结果，分别代表雄性和雌性样本；

本申请实施例中，所述纯合SNP分子标记，即指两条同源基因上的SNP位点是同样的碱基，所述杂合SNP分子标记，即指两条同源基因上的SNP位点是不同的碱基；

本申请实施例中，以实际解剖获得的性别结果对上述鉴定结果进行验证。

第四方面，本申请实施例提供了一种检测所述SNP标记的试剂盒，所述试剂盒包含第二方面所述引物以及其他用于扩增所述SNP标记的试剂。

第五方面，本申请实施例提供了第一方面所述SNP分子标记的筛选方法，其步骤包括：

获得原始序列集，所述原始序列集是对DNA样本的进行全基因组测序得到的原始序列集合构成，所述DNA样本包括雄性混合池、雌性混合池、8个雄性单样本和8个雌性单样本；