[发明专利]一种鉴别不同人群的方法有效
申请号: | 202210221732.8 | 申请日: | 2022-03-09 |
公开(公告)号: | CN114736970B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 韩洋;何昆仑;姚咏明;田亚平;赵晓静 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军总医院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/689;G16B25/20;G16B30/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 高倩倩 |
地址: | 100853*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 不同 人群 方法 | ||
1.检测微生物丰度水平的试剂在制备用于鉴别或区分不同民族人群的产品中的应用,其特征在于,所述微生物包括s_Actinobacillus succinogenes、s_Actinomycessp.HMSC035G02、s_Alistipes indistinctus、s_Citrobacter sp.MGH110、s_Clostridiumsp.CAG_58、s_Cohnella sp.OV330、s_Fibrobacter sp.UWOV1、s_Klebsiella sp.OBRC7、s_Klebsiella variicola、s_Kluyvera ascorbata、s_Kytococcus sedentarius、s_Lactobacillus kefiranofaciens、s_Lactococcus garvieae、s_Lysobacterenzymogenes、s_Olsenella umbonata、s_Paenibacillus massiliensis、s_Pantoeaananatis、s_Peptostreptococcus sp.D1、s_Porphyromonas sp.HMSC065F10、s_Prevotella aurantiaca、s_Slackia piriformis、s_Candidatus Saccharibacteria oraltaxon TM7x和s_Lachnospiraceae bacterium KHCPX20;
所述不同民族人群为汉族人群和藏族人群。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的产品包括试剂盒、芯片或高通量测序平台。
4.微生物在构建不同民族人群的分类模型中的应用,其特征在于,所述微生物包括s_Actinobacillus succinogenes、s_Actinomyces sp.HMSC035G02、s_Alistipesindistinctus、s_Citrobacter sp.MGH110、s_Clostridium sp.CAG_58、s_Cohnellasp.OV330、s_Fibrobacter sp.UWOV1、s_Klebsiella sp.OBRC7、s_Klebsiella variicola、s_Kluyvera ascorbata、s_Kytococcus sedentarius、s_Lactobacilluskefiranofaciens、s_Lactococcus garvieae、s_Lysobacter enzymogenes、s_Olsenellaumbonata、s_Paenibacillus massiliensis、s_Pantoea ananatis、s_Peptostreptococcussp.D1、s_Porphyromonas sp.HMSC065F10、s_Prevotella aurantiaca、s_Slackiapiriformis、s_Candidatus Saccharibacteria oral taxon TM7x和s_Lachnospiraceaebacterium KHCPX20;
所述不同民族人群为汉族人群和藏族人群。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的不同民族人群的分类模型使用选自以下一种或更多种算法来确定:XGBoost、随机森林、glmnet、cforest、机器学习的分类与回归树、treebag、K-毗邻、神经网络、支持向量机径向、支持向量机线性、朴素贝叶斯或多层感知。
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