[发明专利]一种鉴别不同人群的方法有效
申请号: | 202210221732.8 | 申请日: | 2022-03-09 |
公开(公告)号: | CN114736970B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 韩洋;何昆仑;姚咏明;田亚平;赵晓静 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军总医院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/689;G16B25/20;G16B30/00;G16B40/00 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 不同 人群 方法 | ||
本发明公开了一种鉴别不同人群的方法,具体的,本发明首次公开了23种微生物可用于鉴别或区分不同民族人群,所述不同民族人群为汉族人群和藏族人群。此外,本发明还提供了微生物在构建不同人群的分类模型中的应用。
技术领域
本发明属于生物医药领域,具体涉及一种鉴别不同人群的方法。
背景技术
大多数肠道微生物对人体生理和健康都有着重要影响,它们对人类生命至关重要。肠道菌群与肠道细胞之间的相互作用可以调节屏障功能,不断刺激免疫系统防御病原体。肠道菌群与宿主之间的平衡如果发生了改变,可能会导致机体产生各种疾病。高海拔地区缺氧环境的人群成功地在极端环境条件下逐代繁衍,因此其对高海拔地区缺氧环境的快速适应机制也一直是科学家们关注的热点问题。长期生活在极端环境中的人群独特的饮食习惯和生活方式使得他们的肠道菌群具有独特结构组成,研究菌群的特殊结构与藏族的疾病的关系,有利于探讨高原疾病发生机理。
发明内容
本发明的第一目的在于提供微生物在鉴别或区分不同民族人群中的应用;
本发明的第二目的在于提供一种鉴别或区分不同民族人群的方法。
为实现上述目的,本发明采用了如下技术方案:
本发明第一方面提供了一种可用于鉴别或区分不同民族人群的试剂,所述的试剂能够检测微生物的丰度水平,所述的微生物包括s_Actinobacillus succinogenes、s_Actinomyces sp.HMSC035G02、s_Alistipes indistinctus、s_Citrobacter sp.MGH110、s_Clostridium sp.CAG_58、s_Cohnella sp.OV330、s_Fibrobacter sp.UWOV1、s_Klebsiellasp.OBRC7、s_Klebsiella variicola、s_Kluyvera ascorbata、s_Kytococcussedentarius、s_Lactobacillus kefiranofaciens、s_Lactococcus garvieae、s_Lysobacter enzymogenes、s_Olsenella umbonata、s_Paenibacillus massiliensis、s_Pantoea ananatis、s_Peptostreptococcus sp.D1、s_Porphyromonas sp.HMSC065F10、s_Prevotella aurantiaca、s_Slackia piriformis、s_Candidatus Saccharibacteria oraltaxon TM7x和/或s_Lachnospiraceae bacterium KHCPX20。
术语“和/或”是指并且包括一个或多个相关联的所列项目的任何和所有可能的组合,以及在备选方案(或)中解释时缺少组合。
术语“丰度”是指生物样品中目标微生物的数量的量度。“丰度”也被称为“负载”。一般通过分子方法,典型地通过例如荧光原位杂交(FISH)、定量聚合酶链反应(qPCR)或PCR/焦磷酸测序测定所述的目标微生物的16SrRNA基因拷贝数,进行细菌定量。生物样品内目标核酸序列丰度的定量可能是绝对的或相对的。“相对定量”通常是基于一个或多个内部参考基因,即来自参考菌株的16S rRNA基因,比如使用通用引物并且将目标核酸序列的丰度表达为总细菌16S rRNA基因拷贝的百分比或通过大肠杆菌16SrRNA基因拷贝归一化而测定的细菌。“绝对定量”通过与DNA标准进行比较或通过DNA浓度归一化来给出目标分子的确切数目。
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