[发明专利]基于5hmC分子标志物检测的肠癌模型及肠癌模型构建方法有效

专利信息
申请号: 202210250395.5 申请日: 2022-03-15
公开(公告)号: CN114373511B 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 丁轶;俞露;张耀伟;刘洋;郭绮晴 申请(专利权)人: 南方医科大学南方医院
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B50/00;G16B25/10;G16H50/20
代理公司: 广州天河万研知识产权代理事务所(普通合伙) 44418 代理人: 刘茂龙
地址: 510515 广东省广州市白云区京*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 hmc 分子 标志 检测 肠癌 模型 构建 方法
【说明书】:

本申请公开了基于5hmC分子标志物检测的肠癌模型,包括带参数的核心模型,所述的带参数的核心模型具体是基于分子标志物作为参数的肠癌模型,还包括案例收集单元、案例检验单元、错误收集单元、按组分析单元、循环修改单元,所述的案例收集单元输出端与案例检验单元交互连接,所述的案例检验单元输出端与错误收集单元交互连接,所述的错误收集单元输出端与按组分析单元交互连接,所述的按组分析单元与循环修改单元交互连接,所述的循环修改单元与带参数的核心模型双向交互连接,所述的带参数的核心模型还与案例检验单元双向交互连接,本申请公开了基于5hmC分子标志物检测的肠癌模型构建方法。

技术领域

本申请涉及基于5hmC分子标志物检测的肠癌模型及其构建方法。

背景技术

近年来基于分子标志物检测的肠癌模型研究成为了热点,主要是因为基于分子标志物预测肠癌具有很多优点,主要在其具有微创、灵敏、高效且监测者依从性好的特点,相关的现有技术也有很多,比如中国专利文献201710662851.6公开了一种用于检测胰腺癌的基因标志物、试剂盒及胰腺癌检测方法。中国专利文献201710662852.0公开了用于检测肝肿瘤良恶性的基因标志物、试剂盒及检测方法。还有中国专利文献201910026672.2 公开的一种基于表观修饰的5hmC多分子标志物及结直肠癌早期诊断模型,该技术的核心是选择基于标志物,所述基因标志物包括:GBX2 FAM8A FAM25B LCE1F FBXL7 DBX1 KRTAP27-1AL353791.1 CEBPD LTB4R2 RP4-583P15.1 OR5B2 RPRM RNASE INSL5 AURKC IL36AAC017081.1 SPA17 NBPF12 FABP1CST8。然后以被监测者的上选择的基因标志物5-hmC表达量标准化结果;将其标准化结果输入到提前建立的回归模型中,然后判断回归模型的评分作为判断被监测者是否患有结直肠癌参考。在该技术中虽然通过非常多的标志物参与了评判但是在回归模型建立中并不能最精准确定相应标志物的标准化结果以及参与回归模型判断的参数,实质上标准化结果以及回归模型判断的参数都是基于以往经验做出的,并且这种经验并不能完全符合实际情况,所以在使用之前回归模型进行判断中还有可能出现错误判例,这样就使得现有基于分子标志物检测的肠癌模型不能最精准对结直肠癌给出参考。

发明内容

本申请提供基于5hmC分子标志物检测的肠癌模型,包括带参数的核心模型,所述的带参数的核心模型具体是基于分子标志物作为参数的肠癌模型,其特征在于,还包括案例收集单元、案例检验单元、错误收集单元、按组分析单元、循环修改单元,所述的案例收集单元输出端与案例检验单元交互连接,所述的案例检验单元输出端与错误收集单元交互连接,所述的错误收集单元输出端与按组分析单元交互连接,所述的按组分析单元与循环修改单元交互连接,所述的循环修改单元与带参数的核心模型双向交互连接,所述的带参数的核心模型还与案例检验单元双向交互连接;

所述的案例收集单元用于收集被监测者的基因标志物对应的数据,所述的被监测者的基因标志物对应的数据中包括被监测者的ID号数据项、被监测者的确诊结果数据项、被监测者的各项基因标志物对应的数值;

所述的案例检验单元用于每次基于若干组的被监测者的基因标志物对应的数据对带参数的核心模型进行检验,并且输出检验错误的若干组被监测者的基因标志物对应的数据;

所述的错误收集单元用于收集检验错误的若干组被监测者的基因标志物对应的数据,并且将其传输给按组分析单元;

所述的按组分析单元用于将“带参数的核心模型”中的参数分组,针对每一组的参数作为可变的变量进行一次分析,所述的分析具体是通过训练学习“检验错误的若干组被监测者的基因标志物对应的数据”进而修改“带参数的核心模型”中的参数;还用于将修改之后的参数传输给循环修改单元;

所述的循环修改单元用于在每一次获取“修改之后的参数”之后对“带参数的核心模型”中参数修改,并且还用于循环执行上述的修改。

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