[发明专利]一种肺癌早期智能诊断的多价可激活适配体探针及其制备与应用在审
申请号: | 202210279615.7 | 申请日: | 2022-03-21 |
公开(公告)号: | CN114540360A | 公开(公告)日: | 2022-05-27 |
发明(设计)人: | 陈嘉玲;向佳辉;李岱容;彭海洋 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;G01N33/569;G01N33/574;G01N33/58;G01N33/533;C09K11/06 |
代理公司: | 重庆渝之知识产权代理有限公司 50249 | 代理人: | 彭周 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肺癌 早期 智能 诊断 多价可 激活 适配体 探针 及其 制备 应用 | ||
1.一种S1适配体荧光探针S1-polyA,其特征在于,所述荧光探针为5’端标记有荧光报告基团的S1适配体,所述S1适配体的3’端连接有一段延伸的A碱基链,序列如SEQ ID NO.1所示:
GGTTGCATGCCGTGGGGAGGGGGGTGGGTTTTATAGCGTACTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA(SEQ IDNO.1)。
2.根据权利要求1所述的S1适配体荧光探针S1-polyA,其特征在于:所述荧光报告基团选自HEX、FAM、Cy3、Cy5中的至少一种。
3.一种双链结构,其特征在于:所述双链结构包括如权利要求1~2任一项所述的荧光探针,还包括3’端标记有荧光淬灭基团的互补链S1-CP,所述荧光探针与所述互补链S1-CP部分互补形成双链结构,所述带有淬灭基团的互补链S1-CP的序列如SEQ ID NO.2所示:
CCACGGCATGCAACC(SEQ ID NO.2)。
4.根据权利要求3所述的双链结构,其特征在于:所述荧光淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、BHQ3中的至少一种。
5.一种多价可激活适配体探针,其特征在于:包括长DNA连接支架,所述长DNA连接支架上偶联有若干个如权利要求1~2任一项所述的荧光探针S1-polyA,所述荧光探针S1-polyA与3’端标记有荧光淬灭基团的互补链S1-CP部分互补形成双链结构,所述带有淬灭基团的互补链S1-CP的序列如SEQ ID NO.2所示:
CCACGGCATGCAACC(SEQ ID NO.2)。
6.根据权利要求5所述的多价可激活适配体探针,其特征在于:所述荧光淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、BHQ3中的至少一种;
和/或,将荧光探针S1-polyA、互补链S1-CP混合后加热至95℃反应10min,然后缓慢冷却至室温,再加入长DNA连接支架混匀反应,构建得到所述多价可激活适配体探针;
和/或,所述长DNA连接支架通过杂交链式反应合成,制备过程如下:将诱导链intiator、发夹结构hairpin1和hairpin2混合进行孵育,制得长DNA连接支架;
所述发夹结构hairpin1和hairpin2由hairpin1和hairpin2序列在95℃反应5分钟后缓慢降温到室温反应2小时,以充分形成发夹结构;
所述hairpin1、hairpin2和intiator的序列分别如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4和SEQID NO.5所示:
AATAAACCCACCACCCACCCAACGGGTGGGTTGGGTGGGTGGTGGGAGGTGAGGTGAAGTT(SEQ IDNO.3);
TTTTTTTTTTTTTTTGTTGGGTGGGTGGTGGGTTTATTCCCACCACCCACCCAACCCACCC(SEQ IDNO.4);
GTTGGGTGGGTGGTGGGTTTATT(SEQ ID NO.5)。
7.根据权利要求6所述的多价可激活适配体探针,其特征在于:长DNA连接支架与荧光探针S1-polyA的浓度比为1:10,荧光探针S1-polyA与带有淬灭基团的互补链S1-CP的浓度比为1:(0.5~4);
和/或,孵育温度为25℃;
和/或,孵育时间为0.5~24h;
和/或,将50nM~1000nM诱导链intiator与5μM hairpin1和5μM hairpin2混合进行孵育,制得长DNA连接支架。
8.一种根据权利要求5~7任一项所述的多价可激活适配体探针的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:
将荧光探针S1-polyA、互补链S1-CP混合后加热至95℃反应10min,然后缓慢冷却至室温,再加入长DNA连接支架混匀反应,构建得到所述多价可激活适配体探针。
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