[发明专利]一种新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合及其应用在审
申请号: | 202210294701.5 | 申请日: | 2022-03-24 |
公开(公告)号: | CN114561494A | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 张严峻 | 申请(专利权)人: | 浙江省疾病预防控制中心;杭州杰毅生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 黎双华 |
地址: | 310051 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新型 冠状病毒 delta 变异 检测 引物 探针 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,包括针对新型冠状病毒Delta变异株靶点设计的一对特异性扩增引物和一条特异性识别单碱基突变的检测探针,该引物和探针可与新型冠状病毒N基因和人的内标Actin基因的引物探针相组合。
2.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述一对特异性扩增引物的序列选自以下:
SEQ ID NO.1所示的上游引物和SEQ ID NO.2所示的下游引物;
或SEQ ID NO.3所示的上游引物和SEQ ID NO.4所示的下游引物;
或SEQ ID NO.5所示的上游引物和SEQ ID NO.6所示的下游引物。
3.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述一对特异性扩增引物的序列为SEQ ID NO.5所示的上游引物和SEQ ID NO.6所示的下游引物。
4.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,核苷酸序列的Tm值比扩增引物高5~10℃,且GC含量为40%~70%。
5.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述特异性识别单碱基突变的检测探针其序列选自以下:
SEQ ID NO.7所示的序列;
或SEQ ID NO.8所示的序列;
或SEQ ID NO.9所示的序列;
或SEQ ID NO.10所示的序列。
6.根据权利要求5所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述特异性识别单碱基突变的检测探针序列如SEQ ID NO.8或SEQ ID NO.9所示。
7.根据权利要求5所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述特异性识别单碱基突变的检测探针序列如SEQ ID NO.9所示。
8.根据权利要求5所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述特异性识别单碱基突变的检测探针的5’端由ROX修饰,3’端由MGB修饰。
9.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述新型冠状病毒N基因的引物序列如SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.12所示,探针序列如SEQ ID NO.13所示。
10.根据权利要求1所述的用于新型冠状病毒Delta变异株检测的引物探针组合,其特征在于,所述内标Actin基因的引物序列如SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15所示,探针序列如SEQ ID NO.16所示。
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