[发明专利]一种与凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染相关的几丁质结合蛋白基因上的SNP标记及其应用有效
申请号: | 202210311400.9 | 申请日: | 2022-03-28 |
公开(公告)号: | CN114574597B | 公开(公告)日: | 2023-09-29 |
发明(设计)人: | 陈廷;张鑫;陈国良;胡超群;任春华;王艳红;江晓;刘永奎;宋宏斌;周腾;徐涛;杨昊 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 陈洁娣;刘明星 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 凡纳滨 对虾 溶血 弧菌 感染 相关 几丁质 结合 蛋白 基因 snp 标记 及其 应用 | ||
1.鉴别凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染性状相关的SNP分子标记的产品在制备区分凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染能力的试剂中的应用;所述的SNP分子标记位于如SEQ ID NO.1所示的凡纳滨对虾几丁质结合蛋白基因序列的501 bp位点处,突变类型为T纯合、T/A杂合和A纯合。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的SNP分子标记的检测引物为:
LvCBP-SNP-F:5'-CCAAGGCAATGAAACCCTCAGACA-3';
LvCBP-SNP-R:5'-TCATTCATCCATCACCATAAGT-3'。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的SNP分子标记为T纯合基因型的凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染能力显著高于T/A杂合基因型,SNP分子标记为T/A杂合基因型的凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染能力又显著高于A纯合基因型。
4.鉴别凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染性状相关的SNP分子标记的产品在群体选育或耐副溶血弧菌感染凡纳滨对虾高抗品系维持中的应用;所述的SNP分子标记位于如SEQ IDNO.1所示的凡纳滨对虾几丁质结合蛋白基因序列的501 bp位点处,突变类型为T纯合、T/A杂合和A纯合。
5.一种凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染品种的选育方法,其特征在于,包括以下步骤:
a) 提取待测凡纳滨对虾基因组DNA;
b) 利用检测引物LvCBP-SNP-F:5'-CCAAGGCAATGAAACCCTCAGACA-3'和LvCBP-SNP-R:5'-TCATTCATCCATCACCATAAGT-3'对待测凡纳滨对虾基因组DNA进行PCR扩增;
c) 使用LvCBP-SNP-F引物对扩增产物进行Sanger测序,根据测序峰图对凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染性状相关的SNP分子标记进行分型,该SNP分子标记位于如SEQ ID NO.1所示的凡纳滨对虾几丁质结合蛋白基因序列的501 bp位点处,突变类型为T纯合、T/A杂合和A纯合;
d) 选择T纯合型的雌虾和雄虾作为亲本,进行交配产生下一代育种群体。
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