[发明专利]一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的方法和试剂盒在审

专利信息
申请号: 202210335300.X 申请日: 2022-04-01
公开(公告)号: CN114480373A 公开(公告)日: 2022-05-13
发明(设计)人: 陈迪;田甜;张建光;张丽 申请(专利权)人: 北京贝瑞和康生物技术有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 孟凡宏;袁森
地址: 102299 北京市昌平区*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 富集 孕妇 血浆 胎儿 dna 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的方法,包括以下步骤:

1)抽提孕妇血液,以获得血浆DNA;

2)对所述血浆DNA进行末端补平和3’悬A,以获得3’悬A后的血浆DNA;

3)将所述3’悬A后的血浆DNA与测序接头连接,以获得连接产物;

4)将上述步骤3)得到的连接产物和磁珠预混液混匀、磁吸、吸取上清液,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:2-3:2混合;

5)将上述步骤4)得到的上清液与磁珠混匀、磁吸、弃去上清液;

6)对上述步骤5)保留的磁珠进行清洗和洗脱,以获得经富集的胎儿DNA;并且

其中所述步骤2)的末端补平和3’悬A在一个反应体系中进行,且所述步骤2)和3)之间不包括纯化步骤。

2.根据权利要求1所述方法,其中所述步骤4)中,所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:1混合。

3.根据权利要求1所述方法,其中所述磁珠稀释液是浓度为10%-25%的PEG。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述磁珠稀释液是浓度为16%的PEG。

5.权利要求3所述的方法,其中所述PEG是PEG4000、PEG6000或PEG8000。

6.权利要求1所述的方法,其中所述磁珠预混液与上述步骤3)得到的连接产物的体积比是(0.4-0.65):1。

7.权利要求1所述的方法,其中所述步骤5)中,磁珠与上述步骤4)得到的上清液的体积比是(0.1-0.2):1。

8.根据权利要求1所述的方法,其中所述磁珠选用下组中的一种或者多种:Ampure XP磁珠、SPRIselect磁珠、KAPA Pure Beads、VAHTS® DNA Clean Beads、ProNex Beads、TIANSeq DNA片段分选磁珠和CleanNGS磁珠。

9.根据权利要求1所述的方法,其中步骤2)的所述末端补平采用T4 DNA聚合酶进行。

10.根据权利要求1所述的方法,其中步骤2)的所述3’悬A采用klenow ex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合进行。

11.根据权利要求1所述的方法,其中步骤3)的所述连接通过选自以下的一种或两种酶来进行:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。

12.根据权利要求1所述的方法,其中所述测序接头为双链的测序接头。

13.一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的试剂盒,包括:

1)磁珠预混液,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:2-3:2混合而成;

2)磁珠;和

3)用于磁珠清洗和洗脱的试剂。

14.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:1混合而成。

15.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述磁珠稀释液为浓度为10%-25%的PEG。

16.根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述磁珠稀释液为浓度为16%的PEG。

17.根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述PEG是PEG4000、PEG6000或PEG8000。

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