[发明专利]一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的方法和试剂盒在审
申请号: | 202210335300.X | 申请日: | 2022-04-01 |
公开(公告)号: | CN114480373A | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 陈迪;田甜;张建光;张丽 | 申请(专利权)人: | 北京贝瑞和康生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 孟凡宏;袁森 |
地址: | 102299 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 富集 孕妇 血浆 胎儿 dna 方法 试剂盒 | ||
1.一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的方法,包括以下步骤:
1)抽提孕妇血液,以获得血浆DNA;
2)对所述血浆DNA进行末端补平和3’悬A,以获得3’悬A后的血浆DNA;
3)将所述3’悬A后的血浆DNA与测序接头连接,以获得连接产物;
4)将上述步骤3)得到的连接产物和磁珠预混液混匀、磁吸、吸取上清液,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:2-3:2混合;
5)将上述步骤4)得到的上清液与磁珠混匀、磁吸、弃去上清液;
6)对上述步骤5)保留的磁珠进行清洗和洗脱,以获得经富集的胎儿DNA;并且
其中所述步骤2)的末端补平和3’悬A在一个反应体系中进行,且所述步骤2)和3)之间不包括纯化步骤。
2.根据权利要求1所述方法,其中所述步骤4)中,所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:1混合。
3.根据权利要求1所述方法,其中所述磁珠稀释液是浓度为10%-25%的PEG。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述磁珠稀释液是浓度为16%的PEG。
5.权利要求3所述的方法,其中所述PEG是PEG4000、PEG6000或PEG8000。
6.权利要求1所述的方法,其中所述磁珠预混液与上述步骤3)得到的连接产物的体积比是(0.4-0.65):1。
7.权利要求1所述的方法,其中所述步骤5)中,磁珠与上述步骤4)得到的上清液的体积比是(0.1-0.2):1。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述磁珠选用下组中的一种或者多种:Ampure XP磁珠、SPRIselect磁珠、KAPA Pure Beads、VAHTS® DNA Clean Beads、ProNex Beads、TIANSeq DNA片段分选磁珠和CleanNGS磁珠。
9.根据权利要求1所述的方法,其中步骤2)的所述末端补平采用T4 DNA聚合酶进行。
10.根据权利要求1所述的方法,其中步骤2)的所述3’悬A采用klenow ex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶与Taq酶的组合进行。
11.根据权利要求1所述的方法,其中步骤3)的所述连接通过选自以下的一种或两种酶来进行:T4 DNA连接酶和T7 DNA连接酶。
12.根据权利要求1所述的方法,其中所述测序接头为双链的测序接头。
13.一种富集孕妇血浆中胎儿DNA的试剂盒,包括:
1)磁珠预混液,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:2-3:2混合而成;
2)磁珠;和
3)用于磁珠清洗和洗脱的试剂。
14.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述磁珠预混液由磁珠与磁珠稀释液按照体积比1:1混合而成。
15.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述磁珠稀释液为浓度为10%-25%的PEG。
16.根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述磁珠稀释液为浓度为16%的PEG。
17.根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述PEG是PEG4000、PEG6000或PEG8000。
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