[发明专利]一种用于建鲤2号鉴定的分子标记、鉴定方法及应用在审
申请号: | 202210366030.9 | 申请日: | 2022-04-08 |
公开(公告)号: | CN114657263A | 公开(公告)日: | 2022-06-24 |
发明(设计)人: | 唐永凯;李建林;李红霞;王美垚;于凡;苏胜彦;冯文荣 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 无锡华源专利商标事务所(普通合伙) 32228 | 代理人: | 冯智文 |
地址: | 214081 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 分子 标记 方法 应用 | ||
1.一种建鲤2号鉴定的分子标记组合,其特征在于,所述分子标记组合包括13个SNP分子标记,依次为第1-13SNP分子标记,待测建鲤含有13个SNP分子标记中7个以上SNP分子标记即为建鲤2号。
2.根据权利要求1所述的分子标记组合,其特征在于,
第1SNP分子标记为碱基CC,所述SNP标记位于核酸的第30位,所述第1SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
第2SNP分子标记为碱基CC,所述SNP标记位于核酸的第386位,所述核酸具有如SEQ IDNO:2所示核苷酸序列;
第3SNP分子标记为碱基CC,所述SNP标记位于核酸的第450位,所述核酸具有如SEQ IDNO:3所示核苷酸序列;
第4SNP分子标记为碱基GG,所述SNP标记位于核酸的第159位,所述核酸具有如SEQ IDNO:4所示核苷酸序列;
第5SNP分子标记为碱基GG,所述SNP标记位于核酸的第30位,所述核酸具有如SEQ IDNO:5所示核苷酸序列;
第6SNP分子标记为碱基CC,所述SNP标记位于核酸的第511位,所述核酸具有如SEQ IDNO:6所示核苷酸序列;
第7SNP分子标记为碱基AA,所述SNP标记位于核酸的第43位,所述核酸具有如SEQ IDNO:7所示核苷酸序列;
第8SNP分子标记为碱基GG,所述SNP标记位于核酸的第361位,所述核酸具有如SEQ IDNO:8所示核苷酸序列;
第9SNP分子标记为碱基AA,所述SNP标记位于核酸的第212位,所述核酸具有如SEQ IDNO:9所示核苷酸序列;
第10SNP分子标记为碱基AA,所述SNP标记位于核酸的第19位,所述核酸具有如SEQ IDNO:10所示核苷酸序列;
第11SNP分子标记为碱基AA,所述SNP标记位于核酸的第126位,所述核酸具有如SEQ IDNO:11所示核苷酸序列;
第12SNP分子标记为碱基GG,所述SNP标记位于核酸的第99位,所述核酸具有如SEQ IDNO:12所示核苷酸序列;
第13SNP分子标记为碱基CC,所述SNP标记位于核酸的第487位,所述核酸具有如SEQ IDNO:13所示核苷酸序列。
3.根据权利要求1所述的分子标记组合,其特征在于,所述13个SNP分子标记的引物序列依次为:第1-13SNP分子标记的正向引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:14~26所示;第1-13SNP分子标记的反向引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:27~39所示。
4.一种利用权利要求1-3任一项所述的分子标记组合进行建鲤2号鉴定的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)筛选、设计引物;
(2)提取待测建鲤样本的基因组DNA;
(3)PCR扩增:运用PCR仪扩增提取的待测建鲤样本的基因组DNA;
(4)酶切、电泳检测:对PCR扩增产物进行酶切,并用电泳分离检测;
(5)根据电泳条带,分析基因型,获得每个待测建鲤样本的多个SNP分子标记位点的基因型,待测建鲤样本含有7个以上权利要求1所述13个SNP分子标记即为建鲤2号。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,取待测建鲤样本尾部鳍条少量,加入到450ul 1×STE的1.5ml离心管中,同时加入10ul20mg/ml蛋白酶K和12.5ul 20%十二烷基硫酸钠,混匀,置于55℃水浴消化过夜,然后采取酚氯仿法提取DNA,加200ul去离子水溶解后,4℃保存备用。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述PCR扩增的反应体系为:PCR反应总体积为15μL,其中30ng/μL DNA模板2μL,2×Taq PCR Mix 5μL,10μmol/L正向和反向引物各0.5μL,去离子水7μL。
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