[发明专利]一种云上黑山羊SNP标记及其在鉴定云上黑山羊品种中的应用

说明书

本发明涉及一种云上黑山羊SNP标记及其在鉴定云上黑山羊品种中的应用，所述云上黑山羊SNP标记包括26个位点，检测待测羊基因组中上述26个SNP位点的分型结果，将所得26个SNP位点的分型结果带入以参考群数据构建的模型中，计算出每一个SNP位点的分型结果所对应的“是”和“非”的概率值，将26个SNP位点的概率值求和，获得“是”和“非”的总和鉴定概率值，若“是”的总和鉴定概率值大于“非”的总和鉴定概率值，则该待测羊鉴定为云上黑山羊。本发明首次提出用于鉴定云上黑山羊品种的参考群数据模型，采用本发明提供的这26个SNP位点及鉴定技术，对云上黑山羊的鉴定准确率高达89.58％，为今后云上黑山羊的鉴定、保种、以及遗传育种提供了有力的技术支持。

技术领域

本发明涉及动物品种鉴定技术领域，具体涉及一种云上黑山羊SNP标记及其在鉴定云上黑山羊品种中的应用。

技术背景

云上黑山羊是针对本地山羊生长速度慢、产肉少、产羔率低、泌乳性能差、不适宜规模化养殖等不足，由云南省畜牧兽医科学院联合云南省种羊繁育推广中心和相关养殖企业，以努比山羊为父本、云岭黑山羊为母本，经22年5个世代系统选育而成的肉用黑山羊新品种。云上黑山羊具有被毛全黑、生长发育快、常年发情、繁殖力高、产肉性能好、适应性强和耐粗饲等优良特性。周岁公羊体重达53.17kg、母羊41.47kg，成年公羊体重达75.79kg、母羊56.49kg；母羊可两年三产，初产母羊产羔率为181.73％、经产母羊为232.00％，羔羊断奶成活率为90％以上；公羊日增重达257.78g、料肉比5.87:1，母羊日增重188.56g、料肉比7.27:1；6月龄以上公母羊的屠宰率均在53％以上。近10年来，云上黑山羊已在云南省16个州(市)120个县以及北京、天津、上海、重庆、河北、山西、辽宁、安徽、江西、山东、湖北、湖南、广东、海南、四川、贵州、甘肃、青海、广西、宁夏和新疆等21个省(市、自治区)推广应用，共推广种羊14.8万只，改良本地羊1107万只，表明云上黑山羊适宜于舍饲、放牧+补饲或全放牧的饲养方式，并能广泛适应与低海拔河谷地区(低于1000m)到较高海拔(2000m左右)的冷凉区，适合在我国南方山羊养殖主产区推广，具有广阔的应用前景。

随着云上黑山羊产业规模不断扩大、养殖企业逐步增多，为保证云上黑山羊的品种特征、区分真假个体、建立优质优价的市场经营体系、保护云上黑山羊种质资源及其优良性状、提升该品种的品牌价值，需要从基因组层面开展云上黑山羊的品种鉴定工作，深度挖掘该品种特有基因组位点信息。通过基因(SNP)身份证鉴定技术将为云上黑山羊品种鉴定工作提供有力的技术支撑。目前尚无关于用于鉴定云上黑山羊品种的SNP位点的报道，现有技术中对利用SNP位点鉴定羊品种的应用方法也多为通过位点组合或位点匹配的方式来进行鉴定，耗时长且结果准确度还有待于提高。

发明内容

本发明提供了一种云上黑山羊SNP标记及其在鉴定云上黑山羊品种中的应用，用于解决以上问题。

本发明提供的云上黑山羊SNP标记在鉴定云上黑山羊品种中的应用，所述云上黑山羊SNP标记包括26个位点，各位点的位置及多态性如下：

3_116568146位于3号染色体第116568146位，其脱氧核苷酸为C或A；

4_27534255位于4号染色体第27534255位，其脱氧核苷酸为G或A；

5_27394846位于5号染色体第27394846位，其脱氧核苷酸为G或T；

5_96914121位于5号染色体第96914121位，其脱氧核苷酸为A或G；

5_112308839位于5号染色体第112308839位，其脱氧核苷酸为A或G；

7_480924位于7号染色体第480924位，其脱氧核苷酸为C或T；

7_19019153位于7号染色体第19019153位，其脱氧核苷酸为T或A；