[发明专利]一种用于毛花猕猴桃赣猕6号品种鉴定的分子标记引物及开发和应用方法在审
申请号: | 202210379080.0 | 申请日: | 2022-04-12 |
公开(公告)号: | CN114807415A | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 廖光联;徐小彪;黄春辉;钟敏;曲雪艳;贾东峰;刘青 | 申请(专利权)人: | 江西农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6811;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 江西省专利事务所 36100 | 代理人: | 殷勇刚 |
地址: | 330045 江西省南昌*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 猕猴桃 品种 鉴定 分子 标记 引物 开发 应用 方法 | ||
1.一种用于毛花猕猴桃“赣猕6号”品种鉴定的分子标记引物,其特征在于,所述分子标记命名为EST-Ad42,EST-Ad42分子标记包括两个引物,分别为分子标记引物EST-Ad42-F和分子标记引物EST-Ad42-R,所述分子标记引物EST-Ad42-F结构为gttaatttgatcgggatgg,所述分子标记引物EST-Ad42-R结构为gaggagcttgagctgctat,退火温度为62℃。
2.一种权利要求1所述分子标记引物的开发方法,其步骤包括,
(1)从NCBI db EST数据库下载所有的猕猴桃EST序列,并利用SSR Hunter1.3软件,对所有下载的EST序列进行SSR筛查;
(2)SSR筛查的标准是:二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸,最少重复次数分别为7次、5次、4次、4次、3次,获得中间序列;
(3)应用Primer 5.0软件设计猕猴桃EST-SSR引物;
(4)利用设计合成的引物,对毛花猕猴桃“赣猕6号”品种进行PCR扩增,筛选得到分子标记EST-Ad42,EST-Ad42分子标记包括两个引物,分别为分子标记引物EST-Ad42-F和分子标记引物EST-Ad42-R,所述分子标记引物EST-Ad42-F结构为gttaatttgatcgggatgg,所述分子标记引物EST-Ad42-R结构为gaggagcttgagctgctat,退火温度为62℃。
3.如权利要求2所述开发方法,其特征在于,步骤(3)中,猕猴桃EST-SSR引物的设计方法为,选取步骤(2)获得的中间序列200-300bp,输入Primer 5.0软件进行设计,设计参数为:引物序列22±2bp,产物大小150-200bp,引物GC含量40-55%,退火温度50-65℃。
4.一种权利要求1所述分子标记引物的应用方法,其特征在于,
利用权利要求1所述分子标记引物EST-Ad42-F和分子标记引物EST-Ad42-R对“赣猕6号”及“华特”、“赣绿1号”、“赣绿2号”等已报道品种的DNA进行扩增,使用8 w/v%丙烯酰胺凝胶进行检测,硝酸银染色显影,凝胶图谱中的每一条带作为一个分子标记,每条多态性带可视为一个等位基因,根据各分子标记的迁移率及其有无计算所有位点的二元数据,有带记为“1”,无带记为“0”,根据不同条带的大小和数目绘制成1/0矩阵,构建成特异性分子身份证,通过特异性分子身份证鉴定“赣猕6号”。
5.如权利要求4所述应用方法,其特征在于,通过特异性分子身份证,对“华特”、“赣绿1号”、“赣绿2号”进行区分。
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